Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

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Length 913 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CUL4BQ13620 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CUL4BQ13620 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CUL4BQ13620 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CUL4BQ13620 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CUL4BQ13620 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CUL4BQ13620 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CUL4BQ13620 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CUL4BQ13620 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CUL4BQ13620 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CUL4BQ13620 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CUL4BQ13620 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CUL4BQ13620 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CUL4BQ13620 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CUL4BQ13620 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CUL4BQ13620 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CUL4BQ13620 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CUL4BQ13620 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CUL4BQ13620 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CUL4BQ13620 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CUL4BQ13620 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CUL4BQ13620 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CUL4BQ13620 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CUL4BQ13620 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CUL4BQ13620 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CUL4BQ13620 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CUL4BQ13620 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CUL4BQ13620 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CUL4BQ13620 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CUL4BQ13620 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CUL4BQ13620 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CUL4BQ13620 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CUL4BQ13620 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CUL4BQ13620 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CUL4BQ13620 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CUL4BQ13620 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CUL4BQ13620 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CUL4BQ13620 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CUL4BQ13620 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CUL4BQ13620 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CUL4BQ13620 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CUL4BQ13620 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CUL4BQ13620 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CUL4BQ13620 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CUL4BQ13620 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CUL4BQ13620 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CUL4BQ13620 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CUL4BQ13620 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CUL4BQ13620 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CUL4BQ13620 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CUL4BQ13620 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CUL4BQ13620 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CUL4BQ13620 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CUL4BQ13620 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CUL4BQ13620 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CUL4BQ13620 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CUL4BQ13620 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CUL4BQ13620 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CUL4BQ13620 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
CUL4BQ13620 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CUL4BQ13620 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
CUL4BQ13620 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CUL4BQ13620 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CUL4BQ13620 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CUL4BQ13620 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CUL4BQ13620 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CUL4BQ13620 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CUL4BQ13620 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CUL4BQ13620 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CUL4BQ13620 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CUL4BQ13620 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CUL4BQ13620 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CUL4BQ13620 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CUL4BQ13620 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CUL4BQ13620 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CUL4BQ13620 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CUL4BQ13620 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CUL4BQ13620 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CUL4BQ13620 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CUL4BQ13620 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CUL4BQ13620 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CUL4BQ13620 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CUL4BQ13620 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CUL4BQ13620 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CUL4BQ13620 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CUL4BQ13620 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CUL4BQ13620 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CUL4BQ13620 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CUL4BQ13620 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CUL4BQ13620 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CUL4BQ13620 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CUL4BQ13620 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CUL4BQ13620 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CUL4BQ13620 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CUL4BQ13620 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CUL4BQ13620 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CUL4BQ13620 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CUL4BQ13620 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CUL4BQ13620 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CUL4BQ13620 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
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