Protein–RNA interactions for Protein: Q13608

PEX6, Peroxisome assembly factor 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX6Q13608 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PEX6Q13608 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PEX6Q13608 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PEX6Q13608 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
PEX6Q13608 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PEX6Q13608 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PEX6Q13608 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
PEX6Q13608 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PEX6Q13608 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PEX6Q13608 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PEX6Q13608 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PEX6Q13608 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PEX6Q13608 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PEX6Q13608 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PEX6Q13608 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PEX6Q13608 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PEX6Q13608 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PEX6Q13608 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
PEX6Q13608 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PEX6Q13608 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PEX6Q13608 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PEX6Q13608 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PEX6Q13608 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PEX6Q13608 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PEX6Q13608 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PEX6Q13608 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PEX6Q13608 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PEX6Q13608 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PEX6Q13608 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PEX6Q13608 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PEX6Q13608 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
PEX6Q13608 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PEX6Q13608 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PEX6Q13608 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PEX6Q13608 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PEX6Q13608 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PEX6Q13608 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PEX6Q13608 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PEX6Q13608 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PEX6Q13608 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PEX6Q13608 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PEX6Q13608 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PEX6Q13608 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PEX6Q13608 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
PEX6Q13608 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PEX6Q13608 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
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PEX6Q13608 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PEX6Q13608 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
PEX6Q13608 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PEX6Q13608 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PEX6Q13608 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PEX6Q13608 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PEX6Q13608 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PEX6Q13608 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PEX6Q13608 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PEX6Q13608 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PEX6Q13608 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PEX6Q13608 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PEX6Q13608 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PEX6Q13608 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PEX6Q13608 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PEX6Q13608 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PEX6Q13608 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
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PEX6Q13608 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PEX6Q13608 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
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PEX6Q13608 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
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PEX6Q13608 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PEX6Q13608 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PEX6Q13608 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PEX6Q13608 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
PEX6Q13608 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
PEX6Q13608 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PEX6Q13608 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PEX6Q13608 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PEX6Q13608 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
PEX6Q13608 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PEX6Q13608 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PEX6Q13608 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PEX6Q13608 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PEX6Q13608 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PEX6Q13608 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PEX6Q13608 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PEX6Q13608 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PEX6Q13608 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PEX6Q13608 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PEX6Q13608 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PEX6Q13608 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PEX6Q13608 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PEX6Q13608 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
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