Protein–RNA interactions for Protein: Q13601

KRR1, KRR1 small subunit processome component homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 381 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRR1Q13601 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KRR1Q13601 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KRR1Q13601 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KRR1Q13601 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KRR1Q13601 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KRR1Q13601 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KRR1Q13601 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KRR1Q13601 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KRR1Q13601 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KRR1Q13601 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KRR1Q13601 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KRR1Q13601 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KRR1Q13601 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KRR1Q13601 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KRR1Q13601 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KRR1Q13601 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KRR1Q13601 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
KRR1Q13601 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KRR1Q13601 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KRR1Q13601 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
KRR1Q13601 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KRR1Q13601 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KRR1Q13601 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KRR1Q13601 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KRR1Q13601 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KRR1Q13601 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KRR1Q13601 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KRR1Q13601 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KRR1Q13601 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KRR1Q13601 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KRR1Q13601 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KRR1Q13601 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KRR1Q13601 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KRR1Q13601 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KRR1Q13601 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
KRR1Q13601 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KRR1Q13601 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
KRR1Q13601 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KRR1Q13601 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KRR1Q13601 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KRR1Q13601 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KRR1Q13601 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KRR1Q13601 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KRR1Q13601 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KRR1Q13601 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KRR1Q13601 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KRR1Q13601 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
KRR1Q13601 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KRR1Q13601 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KRR1Q13601 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
KRR1Q13601 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KRR1Q13601 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KRR1Q13601 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KRR1Q13601 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KRR1Q13601 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KRR1Q13601 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KRR1Q13601 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KRR1Q13601 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KRR1Q13601 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KRR1Q13601 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KRR1Q13601 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KRR1Q13601 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KRR1Q13601 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KRR1Q13601 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KRR1Q13601 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KRR1Q13601 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KRR1Q13601 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KRR1Q13601 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KRR1Q13601 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KRR1Q13601 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KRR1Q13601 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KRR1Q13601 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KRR1Q13601 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
KRR1Q13601 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
KRR1Q13601 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KRR1Q13601 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KRR1Q13601 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
KRR1Q13601 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
KRR1Q13601 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KRR1Q13601 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KRR1Q13601 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KRR1Q13601 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KRR1Q13601 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KRR1Q13601 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KRR1Q13601 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KRR1Q13601 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
KRR1Q13601 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
KRR1Q13601 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
KRR1Q13601 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
KRR1Q13601 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
KRR1Q13601 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
KRR1Q13601 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
KRR1Q13601 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KRR1Q13601 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KRR1Q13601 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KRR1Q13601 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KRR1Q13601 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KRR1Q13601 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KRR1Q13601 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KRR1Q13601 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
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