Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
NEUROD1Q13562 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
NEUROD1Q13562 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
NEUROD1Q13562 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
NEUROD1Q13562 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
NEUROD1Q13562 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
NEUROD1Q13562 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
NEUROD1Q13562 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
NEUROD1Q13562 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
NEUROD1Q13562 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
NEUROD1Q13562 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
NEUROD1Q13562 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
NEUROD1Q13562 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
NEUROD1Q13562 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
NEUROD1Q13562 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
NEUROD1Q13562 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
NEUROD1Q13562 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
NEUROD1Q13562 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
NEUROD1Q13562 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
NEUROD1Q13562 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
NEUROD1Q13562 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
NEUROD1Q13562 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
NEUROD1Q13562 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
NEUROD1Q13562 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
NEUROD1Q13562 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
NEUROD1Q13562 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
NEUROD1Q13562 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
NEUROD1Q13562 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
NEUROD1Q13562 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
NEUROD1Q13562 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
NEUROD1Q13562 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
NEUROD1Q13562 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
NEUROD1Q13562 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
NEUROD1Q13562 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
NEUROD1Q13562 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
NEUROD1Q13562 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
NEUROD1Q13562 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
NEUROD1Q13562 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
NEUROD1Q13562 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
NEUROD1Q13562 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
NEUROD1Q13562 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
NEUROD1Q13562 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
NEUROD1Q13562 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
NEUROD1Q13562 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
NEUROD1Q13562 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
NEUROD1Q13562 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
NEUROD1Q13562 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
NEUROD1Q13562 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
NEUROD1Q13562 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
NEUROD1Q13562 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
NEUROD1Q13562 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
NEUROD1Q13562 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
NEUROD1Q13562 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
NEUROD1Q13562 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
NEUROD1Q13562 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
NEUROD1Q13562 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
NEUROD1Q13562 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
NEUROD1Q13562 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
NEUROD1Q13562 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
NEUROD1Q13562 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
NEUROD1Q13562 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.02■■■□□ 2.24
NEUROD1Q13562 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
NEUROD1Q13562 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
NEUROD1Q13562 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
NEUROD1Q13562 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
NEUROD1Q13562 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
NEUROD1Q13562 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
NEUROD1Q13562 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
NEUROD1Q13562 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
NEUROD1Q13562 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.24
NEUROD1Q13562 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
NEUROD1Q13562 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.24
NEUROD1Q13562 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
NEUROD1Q13562 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
NEUROD1Q13562 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
NEUROD1Q13562 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
NEUROD1Q13562 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
NEUROD1Q13562 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
NEUROD1Q13562 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
NEUROD1Q13562 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
NEUROD1Q13562 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
NEUROD1Q13562 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
NEUROD1Q13562 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
NEUROD1Q13562 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
NEUROD1Q13562 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
NEUROD1Q13562 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
NEUROD1Q13562 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
NEUROD1Q13562 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
NEUROD1Q13562 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NEUROD1Q13562 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
NEUROD1Q13562 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NEUROD1Q13562 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NEUROD1Q13562 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NEUROD1Q13562 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
NEUROD1Q13562 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NEUROD1Q13562 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC29■■■□□ 2.23
NEUROD1Q13562 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
NEUROD1Q13562 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NEUROD1Q13562 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC29■■■□□ 2.23
NEUROD1Q13562 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC29■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms