Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXE3Q13461 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXE3Q13461 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXE3Q13461 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXE3Q13461 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXE3Q13461 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXE3Q13461 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXE3Q13461 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXE3Q13461 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXE3Q13461 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXE3Q13461 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXE3Q13461 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FOXE3Q13461 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FOXE3Q13461 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FOXE3Q13461 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FOXE3Q13461 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FOXE3Q13461 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FOXE3Q13461 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FOXE3Q13461 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FOXE3Q13461 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FOXE3Q13461 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FOXE3Q13461 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FOXE3Q13461 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FOXE3Q13461 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FOXE3Q13461 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FOXE3Q13461 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FOXE3Q13461 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FOXE3Q13461 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FOXE3Q13461 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FOXE3Q13461 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FOXE3Q13461 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FOXE3Q13461 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FOXE3Q13461 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FOXE3Q13461 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FOXE3Q13461 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FOXE3Q13461 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FOXE3Q13461 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FOXE3Q13461 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FOXE3Q13461 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FOXE3Q13461 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
FOXE3Q13461 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FOXE3Q13461 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FOXE3Q13461 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
FOXE3Q13461 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FOXE3Q13461 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FOXE3Q13461 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FOXE3Q13461 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FOXE3Q13461 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
FOXE3Q13461 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
FOXE3Q13461 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FOXE3Q13461 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FOXE3Q13461 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
FOXE3Q13461 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FOXE3Q13461 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXE3Q13461 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXE3Q13461 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXE3Q13461 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXE3Q13461 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXE3Q13461 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXE3Q13461 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXE3Q13461 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXE3Q13461 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXE3Q13461 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXE3Q13461 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXE3Q13461 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXE3Q13461 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXE3Q13461 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXE3Q13461 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXE3Q13461 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXE3Q13461 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXE3Q13461 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXE3Q13461 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXE3Q13461 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXE3Q13461 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXE3Q13461 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXE3Q13461 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXE3Q13461 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXE3Q13461 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXE3Q13461 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXE3Q13461 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXE3Q13461 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXE3Q13461 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXE3Q13461 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXE3Q13461 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXE3Q13461 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXE3Q13461 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXE3Q13461 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXE3Q13461 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXE3Q13461 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXE3Q13461 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXE3Q13461 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXE3Q13461 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXE3Q13461 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXE3Q13461 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXE3Q13461 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXE3Q13461 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXE3Q13461 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXE3Q13461 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXE3Q13461 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXE3Q13461 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms