Protein–RNA interactions for Protein: Q13424

SNTA1, Alpha-1-syntrophin, humanhuman

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Length 505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTA1Q13424 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNTA1Q13424 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SNTA1Q13424 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNTA1Q13424 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNTA1Q13424 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNTA1Q13424 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNTA1Q13424 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNTA1Q13424 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNTA1Q13424 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNTA1Q13424 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNTA1Q13424 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNTA1Q13424 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNTA1Q13424 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNTA1Q13424 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNTA1Q13424 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNTA1Q13424 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNTA1Q13424 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNTA1Q13424 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNTA1Q13424 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNTA1Q13424 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNTA1Q13424 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNTA1Q13424 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNTA1Q13424 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNTA1Q13424 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNTA1Q13424 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNTA1Q13424 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SNTA1Q13424 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNTA1Q13424 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNTA1Q13424 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNTA1Q13424 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNTA1Q13424 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNTA1Q13424 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNTA1Q13424 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNTA1Q13424 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNTA1Q13424 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNTA1Q13424 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNTA1Q13424 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNTA1Q13424 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNTA1Q13424 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNTA1Q13424 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNTA1Q13424 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNTA1Q13424 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNTA1Q13424 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNTA1Q13424 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNTA1Q13424 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNTA1Q13424 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNTA1Q13424 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNTA1Q13424 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNTA1Q13424 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNTA1Q13424 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNTA1Q13424 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNTA1Q13424 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNTA1Q13424 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNTA1Q13424 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNTA1Q13424 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNTA1Q13424 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNTA1Q13424 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNTA1Q13424 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNTA1Q13424 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNTA1Q13424 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNTA1Q13424 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNTA1Q13424 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNTA1Q13424 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNTA1Q13424 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNTA1Q13424 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNTA1Q13424 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNTA1Q13424 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNTA1Q13424 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNTA1Q13424 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SNTA1Q13424 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNTA1Q13424 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNTA1Q13424 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNTA1Q13424 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNTA1Q13424 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNTA1Q13424 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNTA1Q13424 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNTA1Q13424 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNTA1Q13424 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNTA1Q13424 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNTA1Q13424 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SNTA1Q13424 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNTA1Q13424 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNTA1Q13424 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNTA1Q13424 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNTA1Q13424 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNTA1Q13424 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SNTA1Q13424 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SNTA1Q13424 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNTA1Q13424 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNTA1Q13424 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNTA1Q13424 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNTA1Q13424 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNTA1Q13424 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNTA1Q13424 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNTA1Q13424 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNTA1Q13424 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNTA1Q13424 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNTA1Q13424 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNTA1Q13424 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNTA1Q13424 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
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