Protein–RNA interactions for Protein: Q13409

DYNC1I2, Cytoplasmic dynein 1 intermediate chain 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 638 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DYNC1I2Q13409 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DYNC1I2Q13409 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DYNC1I2Q13409 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DYNC1I2Q13409 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DYNC1I2Q13409 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DYNC1I2Q13409 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DYNC1I2Q13409 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DYNC1I2Q13409 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DYNC1I2Q13409 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DYNC1I2Q13409 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DYNC1I2Q13409 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DYNC1I2Q13409 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DYNC1I2Q13409 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DYNC1I2Q13409 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DYNC1I2Q13409 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DYNC1I2Q13409 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DYNC1I2Q13409 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DYNC1I2Q13409 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DYNC1I2Q13409 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DYNC1I2Q13409 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
DYNC1I2Q13409 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DYNC1I2Q13409 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DYNC1I2Q13409 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DYNC1I2Q13409 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DYNC1I2Q13409 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DYNC1I2Q13409 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DYNC1I2Q13409 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DYNC1I2Q13409 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DYNC1I2Q13409 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DYNC1I2Q13409 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DYNC1I2Q13409 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DYNC1I2Q13409 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DYNC1I2Q13409 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
DYNC1I2Q13409 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DYNC1I2Q13409 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DYNC1I2Q13409 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DYNC1I2Q13409 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DYNC1I2Q13409 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DYNC1I2Q13409 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DYNC1I2Q13409 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DYNC1I2Q13409 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
DYNC1I2Q13409 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DYNC1I2Q13409 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DYNC1I2Q13409 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DYNC1I2Q13409 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DYNC1I2Q13409 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DYNC1I2Q13409 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DYNC1I2Q13409 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DYNC1I2Q13409 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DYNC1I2Q13409 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DYNC1I2Q13409 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DYNC1I2Q13409 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DYNC1I2Q13409 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DYNC1I2Q13409 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DYNC1I2Q13409 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DYNC1I2Q13409 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DYNC1I2Q13409 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DYNC1I2Q13409 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DYNC1I2Q13409 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DYNC1I2Q13409 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DYNC1I2Q13409 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DYNC1I2Q13409 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DYNC1I2Q13409 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DYNC1I2Q13409 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DYNC1I2Q13409 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DYNC1I2Q13409 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DYNC1I2Q13409 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
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DYNC1I2Q13409 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
DYNC1I2Q13409 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DYNC1I2Q13409 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DYNC1I2Q13409 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DYNC1I2Q13409 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DYNC1I2Q13409 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DYNC1I2Q13409 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DYNC1I2Q13409 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DYNC1I2Q13409 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DYNC1I2Q13409 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DYNC1I2Q13409 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DYNC1I2Q13409 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DYNC1I2Q13409 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DYNC1I2Q13409 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DYNC1I2Q13409 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DYNC1I2Q13409 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DYNC1I2Q13409 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DYNC1I2Q13409 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DYNC1I2Q13409 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DYNC1I2Q13409 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DYNC1I2Q13409 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DYNC1I2Q13409 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DYNC1I2Q13409 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DYNC1I2Q13409 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DYNC1I2Q13409 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DYNC1I2Q13409 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DYNC1I2Q13409 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DYNC1I2Q13409 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DYNC1I2Q13409 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
DYNC1I2Q13409 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DYNC1I2Q13409 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DYNC1I2Q13409 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms