Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2Q13309 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SKP2Q13309 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SKP2Q13309 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SKP2Q13309 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SKP2Q13309 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SKP2Q13309 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SKP2Q13309 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SKP2Q13309 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SKP2Q13309 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SKP2Q13309 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SKP2Q13309 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SKP2Q13309 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SKP2Q13309 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SKP2Q13309 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SKP2Q13309 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SKP2Q13309 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SKP2Q13309 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SKP2Q13309 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SKP2Q13309 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SKP2Q13309 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SKP2Q13309 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SKP2Q13309 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SKP2Q13309 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SKP2Q13309 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SKP2Q13309 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SKP2Q13309 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SKP2Q13309 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SKP2Q13309 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SKP2Q13309 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SKP2Q13309 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SKP2Q13309 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SKP2Q13309 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SKP2Q13309 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SKP2Q13309 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SKP2Q13309 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SKP2Q13309 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SKP2Q13309 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SKP2Q13309 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SKP2Q13309 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SKP2Q13309 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SKP2Q13309 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
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SKP2Q13309 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SKP2Q13309 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SKP2Q13309 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SKP2Q13309 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
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SKP2Q13309 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
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SKP2Q13309 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
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SKP2Q13309 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
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SKP2Q13309 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SKP2Q13309 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
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SKP2Q13309 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SKP2Q13309 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SKP2Q13309 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
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SKP2Q13309 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
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SKP2Q13309 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SKP2Q13309 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SKP2Q13309 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SKP2Q13309 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
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SKP2Q13309 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SKP2Q13309 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
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SKP2Q13309 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SKP2Q13309 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SKP2Q13309 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SKP2Q13309 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SKP2Q13309 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SKP2Q13309 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SKP2Q13309 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SKP2Q13309 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SKP2Q13309 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SKP2Q13309 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SKP2Q13309 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
SKP2Q13309 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
SKP2Q13309 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
SKP2Q13309 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SKP2Q13309 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
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