Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLN3Q13286 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLN3Q13286 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CLN3Q13286 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLN3Q13286 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLN3Q13286 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLN3Q13286 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLN3Q13286 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CLN3Q13286 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CLN3Q13286 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLN3Q13286 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLN3Q13286 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLN3Q13286 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLN3Q13286 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLN3Q13286 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLN3Q13286 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLN3Q13286 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLN3Q13286 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLN3Q13286 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLN3Q13286 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLN3Q13286 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLN3Q13286 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLN3Q13286 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLN3Q13286 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CLN3Q13286 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLN3Q13286 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLN3Q13286 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLN3Q13286 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLN3Q13286 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLN3Q13286 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLN3Q13286 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CLN3Q13286 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLN3Q13286 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CLN3Q13286 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CLN3Q13286 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLN3Q13286 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CLN3Q13286 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLN3Q13286 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLN3Q13286 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLN3Q13286 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CLN3Q13286 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CLN3Q13286 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLN3Q13286 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLN3Q13286 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLN3Q13286 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLN3Q13286 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLN3Q13286 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLN3Q13286 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLN3Q13286 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLN3Q13286 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CLN3Q13286 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLN3Q13286 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLN3Q13286 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLN3Q13286 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLN3Q13286 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLN3Q13286 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLN3Q13286 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLN3Q13286 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLN3Q13286 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLN3Q13286 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CLN3Q13286 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLN3Q13286 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLN3Q13286 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLN3Q13286 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLN3Q13286 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLN3Q13286 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLN3Q13286 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLN3Q13286 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLN3Q13286 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLN3Q13286 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CLN3Q13286 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLN3Q13286 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLN3Q13286 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLN3Q13286 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLN3Q13286 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLN3Q13286 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLN3Q13286 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLN3Q13286 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLN3Q13286 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLN3Q13286 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLN3Q13286 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLN3Q13286 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CLN3Q13286 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CLN3Q13286 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLN3Q13286 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLN3Q13286 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLN3Q13286 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLN3Q13286 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CLN3Q13286 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CLN3Q13286 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CLN3Q13286 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLN3Q13286 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLN3Q13286 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLN3Q13286 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLN3Q13286 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLN3Q13286 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CLN3Q13286 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLN3Q13286 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLN3Q13286 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLN3Q13286 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
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