Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIM28Q13263 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIM28Q13263 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIM28Q13263 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIM28Q13263 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIM28Q13263 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIM28Q13263 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIM28Q13263 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIM28Q13263 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIM28Q13263 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIM28Q13263 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIM28Q13263 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIM28Q13263 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIM28Q13263 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIM28Q13263 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIM28Q13263 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIM28Q13263 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIM28Q13263 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIM28Q13263 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIM28Q13263 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIM28Q13263 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIM28Q13263 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIM28Q13263 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIM28Q13263 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIM28Q13263 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIM28Q13263 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIM28Q13263 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIM28Q13263 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIM28Q13263 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIM28Q13263 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM28Q13263 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM28Q13263 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM28Q13263 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM28Q13263 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM28Q13263 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM28Q13263 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM28Q13263 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM28Q13263 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM28Q13263 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM28Q13263 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM28Q13263 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM28Q13263 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM28Q13263 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM28Q13263 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM28Q13263 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM28Q13263 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM28Q13263 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM28Q13263 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRIM28Q13263 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRIM28Q13263 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRIM28Q13263 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRIM28Q13263 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRIM28Q13263 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRIM28Q13263 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
TRIM28Q13263 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRIM28Q13263 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRIM28Q13263 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRIM28Q13263 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRIM28Q13263 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRIM28Q13263 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRIM28Q13263 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRIM28Q13263 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRIM28Q13263 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRIM28Q13263 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TRIM28Q13263 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM28Q13263 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM28Q13263 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM28Q13263 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM28Q13263 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM28Q13263 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM28Q13263 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM28Q13263 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM28Q13263 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM28Q13263 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM28Q13263 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM28Q13263 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM28Q13263 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM28Q13263 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM28Q13263 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM28Q13263 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM28Q13263 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM28Q13263 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM28Q13263 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM28Q13263 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM28Q13263 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM28Q13263 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM28Q13263 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM28Q13263 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM28Q13263 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM28Q13263 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM28Q13263 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM28Q13263 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM28Q13263 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM28Q13263 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM28Q13263 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM28Q13263 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM28Q13263 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM28Q13263 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM28Q13263 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM28Q13263 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
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