Protein–RNA interactions for Protein: Q13258

PTGDR, Prostaglandin D2 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGDRQ13258 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTGDRQ13258 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTGDRQ13258 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTGDRQ13258 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTGDRQ13258 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTGDRQ13258 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTGDRQ13258 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTGDRQ13258 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTGDRQ13258 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTGDRQ13258 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTGDRQ13258 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTGDRQ13258 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTGDRQ13258 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTGDRQ13258 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTGDRQ13258 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTGDRQ13258 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTGDRQ13258 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTGDRQ13258 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTGDRQ13258 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTGDRQ13258 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTGDRQ13258 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTGDRQ13258 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTGDRQ13258 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTGDRQ13258 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PTGDRQ13258 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTGDRQ13258 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTGDRQ13258 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PTGDRQ13258 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTGDRQ13258 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTGDRQ13258 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTGDRQ13258 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTGDRQ13258 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTGDRQ13258 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTGDRQ13258 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTGDRQ13258 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTGDRQ13258 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTGDRQ13258 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTGDRQ13258 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTGDRQ13258 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTGDRQ13258 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTGDRQ13258 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTGDRQ13258 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTGDRQ13258 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTGDRQ13258 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTGDRQ13258 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTGDRQ13258 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTGDRQ13258 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTGDRQ13258 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTGDRQ13258 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTGDRQ13258 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTGDRQ13258 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTGDRQ13258 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTGDRQ13258 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTGDRQ13258 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTGDRQ13258 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTGDRQ13258 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTGDRQ13258 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTGDRQ13258 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTGDRQ13258 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTGDRQ13258 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTGDRQ13258 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTGDRQ13258 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTGDRQ13258 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTGDRQ13258 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTGDRQ13258 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTGDRQ13258 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTGDRQ13258 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTGDRQ13258 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PTGDRQ13258 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTGDRQ13258 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTGDRQ13258 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTGDRQ13258 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTGDRQ13258 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTGDRQ13258 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTGDRQ13258 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTGDRQ13258 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTGDRQ13258 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTGDRQ13258 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTGDRQ13258 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTGDRQ13258 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTGDRQ13258 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTGDRQ13258 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTGDRQ13258 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTGDRQ13258 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTGDRQ13258 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTGDRQ13258 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTGDRQ13258 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTGDRQ13258 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTGDRQ13258 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTGDRQ13258 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTGDRQ13258 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTGDRQ13258 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTGDRQ13258 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PTGDRQ13258 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTGDRQ13258 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTGDRQ13258 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTGDRQ13258 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTGDRQ13258 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTGDRQ13258 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PTGDRQ13258 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
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