Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

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Length 444 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FOXF2Q12947 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FOXF2Q12947 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
FOXF2Q12947 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FOXF2Q12947 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
FOXF2Q12947 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FOXF2Q12947 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FOXF2Q12947 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FOXF2Q12947 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FOXF2Q12947 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
FOXF2Q12947 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FOXF2Q12947 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FOXF2Q12947 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FOXF2Q12947 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FOXF2Q12947 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FOXF2Q12947 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
FOXF2Q12947 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FOXF2Q12947 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FOXF2Q12947 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FOXF2Q12947 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FOXF2Q12947 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FOXF2Q12947 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FOXF2Q12947 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FOXF2Q12947 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FOXF2Q12947 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FOXF2Q12947 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FOXF2Q12947 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FOXF2Q12947 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FOXF2Q12947 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FOXF2Q12947 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FOXF2Q12947 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FOXF2Q12947 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FOXF2Q12947 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FOXF2Q12947 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FOXF2Q12947 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FOXF2Q12947 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FOXF2Q12947 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FOXF2Q12947 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FOXF2Q12947 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FOXF2Q12947 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FOXF2Q12947 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
FOXF2Q12947 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FOXF2Q12947 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FOXF2Q12947 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
FOXF2Q12947 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FOXF2Q12947 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
FOXF2Q12947 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FOXF2Q12947 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FOXF2Q12947 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
FOXF2Q12947 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
FOXF2Q12947 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
FOXF2Q12947 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FOXF2Q12947 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FOXF2Q12947 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FOXF2Q12947 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FOXF2Q12947 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FOXF2Q12947 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FOXF2Q12947 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FOXF2Q12947 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
FOXF2Q12947 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FOXF2Q12947 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FOXF2Q12947 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FOXF2Q12947 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
FOXF2Q12947 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FOXF2Q12947 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FOXF2Q12947 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FOXF2Q12947 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FOXF2Q12947 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
FOXF2Q12947 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
FOXF2Q12947 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FOXF2Q12947 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
FOXF2Q12947 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FOXF2Q12947 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FOXF2Q12947 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FOXF2Q12947 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FOXF2Q12947 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FOXF2Q12947 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FOXF2Q12947 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FOXF2Q12947 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FOXF2Q12947 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FOXF2Q12947 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
FOXF2Q12947 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FOXF2Q12947 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
FOXF2Q12947 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FOXF2Q12947 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FOXF2Q12947 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FOXF2Q12947 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FOXF2Q12947 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
FOXF2Q12947 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FOXF2Q12947 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FOXF2Q12947 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FOXF2Q12947 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FOXF2Q12947 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FOXF2Q12947 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FOXF2Q12947 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FOXF2Q12947 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FOXF2Q12947 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FOXF2Q12947 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FOXF2Q12947 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FOXF2Q12947 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
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