Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPN13Q12923 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPN13Q12923 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPN13Q12923 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
PTPN13Q12923 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.34
PTPN13Q12923 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.34
PTPN13Q12923 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.34
PTPN13Q12923 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.34
PTPN13Q12923 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPN13Q12923 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPN13Q12923 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPN13Q12923 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPN13Q12923 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPN13Q12923 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPN13Q12923 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPN13Q12923 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPN13Q12923 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPN13Q12923 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPN13Q12923 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPN13Q12923 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPN13Q12923 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPN13Q12923 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPN13Q12923 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPN13Q12923 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPN13Q12923 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPN13Q12923 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPN13Q12923 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPN13Q12923 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPN13Q12923 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPN13Q12923 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPN13Q12923 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPN13Q12923 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPN13Q12923 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPN13Q12923 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPN13Q12923 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPN13Q12923 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPN13Q12923 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPN13Q12923 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPN13Q12923 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPN13Q12923 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPN13Q12923 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPN13Q12923 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPN13Q12923 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPN13Q12923 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPN13Q12923 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPN13Q12923 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPN13Q12923 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPN13Q12923 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPN13Q12923 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPN13Q12923 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPN13Q12923 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPN13Q12923 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPN13Q12923 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPN13Q12923 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPN13Q12923 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPN13Q12923 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPN13Q12923 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPN13Q12923 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPN13Q12923 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPN13Q12923 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPN13Q12923 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPN13Q12923 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPN13Q12923 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPN13Q12923 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPN13Q12923 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPN13Q12923 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPN13Q12923 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPN13Q12923 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPN13Q12923 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPN13Q12923 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPN13Q12923 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPN13Q12923 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPN13Q12923 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPN13Q12923 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPN13Q12923 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPN13Q12923 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPN13Q12923 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPN13Q12923 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPN13Q12923 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPN13Q12923 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPN13Q12923 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPN13Q12923 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPN13Q12923 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPN13Q12923 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPN13Q12923 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPN13Q12923 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPN13Q12923 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPN13Q12923 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPN13Q12923 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPN13Q12923 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPN13Q12923 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPN13Q12923 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPN13Q12923 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPN13Q12923 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPN13Q12923 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPN13Q12923 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPN13Q12923 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPN13Q12923 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPN13Q12923 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPN13Q12923 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
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