Protein–RNA interactions for Protein: Q12769

NUP160, Nuclear pore complex protein Nup160, humanhuman

Predictions only

Length 1,436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP160Q12769 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC31.85■■■□□ 2.69
NUP160Q12769 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC31.85■■■□□ 2.69
NUP160Q12769 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC31.85■■■□□ 2.69
NUP160Q12769 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC31.85■■■□□ 2.69
NUP160Q12769 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC31.85■■■□□ 2.69
NUP160Q12769 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
NUP160Q12769 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.85■■■□□ 2.69
NUP160Q12769 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.85■■■□□ 2.69
NUP160Q12769 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC31.84■■■□□ 2.69
NUP160Q12769 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
NUP160Q12769 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
NUP160Q12769 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC31.84■■■□□ 2.69
NUP160Q12769 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC31.84■■■□□ 2.69
NUP160Q12769 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC31.84■■■□□ 2.69
NUP160Q12769 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
NUP160Q12769 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC31.84■■■□□ 2.69
NUP160Q12769 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC31.84■■■□□ 2.69
NUP160Q12769 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.84■■■□□ 2.69
NUP160Q12769 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC31.84■■■□□ 2.69
NUP160Q12769 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC31.84■■■□□ 2.69
NUP160Q12769 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC31.84■■■□□ 2.69
NUP160Q12769 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
NUP160Q12769 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
NUP160Q12769 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC31.83■■■□□ 2.69
NUP160Q12769 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC31.83■■■□□ 2.69
NUP160Q12769 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC31.83■■■□□ 2.69
NUP160Q12769 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC31.83■■■□□ 2.69
NUP160Q12769 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC31.83■■■□□ 2.69
NUP160Q12769 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
NUP160Q12769 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC31.83■■■□□ 2.69
NUP160Q12769 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC31.83■■■□□ 2.69
NUP160Q12769 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
NUP160Q12769 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
NUP160Q12769 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC31.83■■■□□ 2.69
NUP160Q12769 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
NUP160Q12769 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
NUP160Q12769 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
NUP160Q12769 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
NUP160Q12769 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC31.83■■■□□ 2.69
NUP160Q12769 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
NUP160Q12769 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC31.83■■■□□ 2.69
NUP160Q12769 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC31.83■■■□□ 2.69
NUP160Q12769 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC31.82■■■□□ 2.68
NUP160Q12769 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
NUP160Q12769 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.82■■■□□ 2.68
NUP160Q12769 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
NUP160Q12769 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC31.82■■■□□ 2.68
NUP160Q12769 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
NUP160Q12769 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC31.82■■■□□ 2.68
NUP160Q12769 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC31.82■■■□□ 2.68
NUP160Q12769 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
NUP160Q12769 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
NUP160Q12769 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC31.81■■■□□ 2.68
NUP160Q12769 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
NUP160Q12769 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
NUP160Q12769 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
NUP160Q12769 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC31.81■■■□□ 2.68
NUP160Q12769 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC31.81■■■□□ 2.68
NUP160Q12769 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC31.81■■■□□ 2.68
NUP160Q12769 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC31.81■■■□□ 2.68
NUP160Q12769 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC31.81■■■□□ 2.68
NUP160Q12769 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC31.81■■■□□ 2.68
NUP160Q12769 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
NUP160Q12769 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
NUP160Q12769 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
NUP160Q12769 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
NUP160Q12769 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC31.8■■■□□ 2.68
NUP160Q12769 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC31.8■■■□□ 2.68
NUP160Q12769 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
NUP160Q12769 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.79■■■□□ 2.68
NUP160Q12769 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.79■■■□□ 2.68
NUP160Q12769 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC31.79■■■□□ 2.68
NUP160Q12769 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
NUP160Q12769 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
NUP160Q12769 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.79■■■□□ 2.68
NUP160Q12769 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
NUP160Q12769 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC31.79■■■□□ 2.68
NUP160Q12769 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC31.79■■■□□ 2.68
NUP160Q12769 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC31.79■■■□□ 2.68
NUP160Q12769 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
NUP160Q12769 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC31.79■■■□□ 2.68
NUP160Q12769 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC31.79■■■□□ 2.68
NUP160Q12769 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC31.78■■■□□ 2.68
NUP160Q12769 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
NUP160Q12769 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC31.78■■■□□ 2.68
NUP160Q12769 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
NUP160Q12769 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC31.78■■■□□ 2.68
NUP160Q12769 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC31.78■■■□□ 2.68
NUP160Q12769 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.78■■■□□ 2.68
NUP160Q12769 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.78■■■□□ 2.68
NUP160Q12769 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
NUP160Q12769 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.78■■■□□ 2.68
NUP160Q12769 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
NUP160Q12769 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC31.78■■■□□ 2.68
NUP160Q12769 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC31.78■■■□□ 2.68
NUP160Q12769 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
NUP160Q12769 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC31.78■■■□□ 2.68
NUP160Q12769 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
NUP160Q12769 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC31.77■■■□□ 2.68
NUP160Q12769 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
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