Protein–RNA interactions for Protein: Q0P6D6

CCDC15, Coiled-coil domain-containing protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC15Q0P6D6 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC15Q0P6D6 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC15Q0P6D6 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC15Q0P6D6 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC15Q0P6D6 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC15Q0P6D6 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC15Q0P6D6 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC15Q0P6D6 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC15Q0P6D6 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC15Q0P6D6 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC15Q0P6D6 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC15Q0P6D6 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC15Q0P6D6 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC15Q0P6D6 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC15Q0P6D6 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC15Q0P6D6 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC15Q0P6D6 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC15Q0P6D6 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC15Q0P6D6 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC15Q0P6D6 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC15Q0P6D6 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC15Q0P6D6 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC15Q0P6D6 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC15Q0P6D6 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC15Q0P6D6 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC15Q0P6D6 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC15Q0P6D6 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC15Q0P6D6 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC15Q0P6D6 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC15Q0P6D6 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC15Q0P6D6 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC15Q0P6D6 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC15Q0P6D6 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC15Q0P6D6 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC15Q0P6D6 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC15Q0P6D6 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC15Q0P6D6 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC15Q0P6D6 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC15Q0P6D6 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC15Q0P6D6 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC15Q0P6D6 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC15Q0P6D6 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC15Q0P6D6 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC15Q0P6D6 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC15Q0P6D6 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC15Q0P6D6 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC15Q0P6D6 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC15Q0P6D6 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC15Q0P6D6 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC15Q0P6D6 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC15Q0P6D6 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC15Q0P6D6 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC15Q0P6D6 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC15Q0P6D6 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC15Q0P6D6 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC15Q0P6D6 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC15Q0P6D6 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC15Q0P6D6 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC15Q0P6D6 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC15Q0P6D6 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC15Q0P6D6 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC15Q0P6D6 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC15Q0P6D6 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC15Q0P6D6 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC15Q0P6D6 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC15Q0P6D6 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC15Q0P6D6 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC15Q0P6D6 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC15Q0P6D6 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC15Q0P6D6 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC15Q0P6D6 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC15Q0P6D6 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC15Q0P6D6 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC15Q0P6D6 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC15Q0P6D6 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC15Q0P6D6 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC15Q0P6D6 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC15Q0P6D6 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC15Q0P6D6 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC15Q0P6D6 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC15Q0P6D6 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC15Q0P6D6 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC15Q0P6D6 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC15Q0P6D6 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC15Q0P6D6 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC15Q0P6D6 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC15Q0P6D6 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC15Q0P6D6 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC15Q0P6D6 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC15Q0P6D6 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC15Q0P6D6 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC15Q0P6D6 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC15Q0P6D6 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC15Q0P6D6 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC15Q0P6D6 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC15Q0P6D6 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC15Q0P6D6 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC15Q0P6D6 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC15Q0P6D6 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC15Q0P6D6 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms