Protein–RNA interactions for Protein: Q06828

FMOD, Fibromodulin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FMODQ06828 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
FMODQ06828 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
FMODQ06828 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
FMODQ06828 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
FMODQ06828 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
FMODQ06828 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
FMODQ06828 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
FMODQ06828 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
FMODQ06828 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
FMODQ06828 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
FMODQ06828 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
FMODQ06828 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
FMODQ06828 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
FMODQ06828 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
FMODQ06828 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
FMODQ06828 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
FMODQ06828 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
FMODQ06828 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
FMODQ06828 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
FMODQ06828 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FMODQ06828 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FMODQ06828 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FMODQ06828 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FMODQ06828 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FMODQ06828 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FMODQ06828 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FMODQ06828 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FMODQ06828 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FMODQ06828 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FMODQ06828 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FMODQ06828 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FMODQ06828 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FMODQ06828 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FMODQ06828 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FMODQ06828 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
FMODQ06828 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FMODQ06828 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FMODQ06828 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FMODQ06828 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FMODQ06828 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FMODQ06828 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FMODQ06828 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FMODQ06828 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FMODQ06828 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FMODQ06828 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FMODQ06828 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FMODQ06828 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FMODQ06828 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FMODQ06828 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
FMODQ06828 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
FMODQ06828 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FMODQ06828 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FMODQ06828 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FMODQ06828 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FMODQ06828 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FMODQ06828 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FMODQ06828 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FMODQ06828 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FMODQ06828 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FMODQ06828 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FMODQ06828 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FMODQ06828 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
FMODQ06828 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FMODQ06828 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FMODQ06828 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FMODQ06828 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FMODQ06828 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FMODQ06828 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FMODQ06828 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FMODQ06828 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FMODQ06828 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FMODQ06828 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FMODQ06828 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FMODQ06828 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FMODQ06828 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FMODQ06828 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FMODQ06828 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FMODQ06828 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FMODQ06828 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
FMODQ06828 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FMODQ06828 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
FMODQ06828 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FMODQ06828 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FMODQ06828 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FMODQ06828 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FMODQ06828 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
FMODQ06828 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FMODQ06828 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FMODQ06828 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FMODQ06828 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FMODQ06828 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FMODQ06828 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FMODQ06828 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FMODQ06828 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FMODQ06828 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FMODQ06828 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FMODQ06828 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FMODQ06828 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FMODQ06828 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FMODQ06828 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms