Protein–RNA interactions for Protein: Q06710

PAX8, Paired box protein Pax-8, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX8Q06710 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PAX8Q06710 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PAX8Q06710 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PAX8Q06710 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PAX8Q06710 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PAX8Q06710 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PAX8Q06710 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PAX8Q06710 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PAX8Q06710 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PAX8Q06710 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PAX8Q06710 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PAX8Q06710 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PAX8Q06710 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PAX8Q06710 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PAX8Q06710 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PAX8Q06710 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PAX8Q06710 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PAX8Q06710 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PAX8Q06710 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PAX8Q06710 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PAX8Q06710 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PAX8Q06710 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PAX8Q06710 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PAX8Q06710 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PAX8Q06710 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PAX8Q06710 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PAX8Q06710 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PAX8Q06710 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PAX8Q06710 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PAX8Q06710 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PAX8Q06710 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PAX8Q06710 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PAX8Q06710 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PAX8Q06710 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PAX8Q06710 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PAX8Q06710 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PAX8Q06710 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PAX8Q06710 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PAX8Q06710 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PAX8Q06710 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PAX8Q06710 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PAX8Q06710 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PAX8Q06710 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PAX8Q06710 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PAX8Q06710 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PAX8Q06710 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PAX8Q06710 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PAX8Q06710 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PAX8Q06710 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PAX8Q06710 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PAX8Q06710 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PAX8Q06710 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PAX8Q06710 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PAX8Q06710 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PAX8Q06710 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PAX8Q06710 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PAX8Q06710 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PAX8Q06710 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PAX8Q06710 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PAX8Q06710 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PAX8Q06710 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PAX8Q06710 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PAX8Q06710 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PAX8Q06710 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PAX8Q06710 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PAX8Q06710 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PAX8Q06710 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PAX8Q06710 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PAX8Q06710 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PAX8Q06710 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
PAX8Q06710 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
PAX8Q06710 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
PAX8Q06710 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PAX8Q06710 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PAX8Q06710 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PAX8Q06710 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PAX8Q06710 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PAX8Q06710 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PAX8Q06710 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PAX8Q06710 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PAX8Q06710 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PAX8Q06710 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PAX8Q06710 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PAX8Q06710 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PAX8Q06710 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PAX8Q06710 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PAX8Q06710 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PAX8Q06710 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PAX8Q06710 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PAX8Q06710 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PAX8Q06710 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PAX8Q06710 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PAX8Q06710 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PAX8Q06710 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PAX8Q06710 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PAX8Q06710 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PAX8Q06710 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PAX8Q06710 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PAX8Q06710 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PAX8Q06710 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms