Protein–RNA interactions for Protein: Q06323

PSME1, Proteasome activator complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME1Q06323 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PSME1Q06323 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PSME1Q06323 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PSME1Q06323 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PSME1Q06323 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PSME1Q06323 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PSME1Q06323 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PSME1Q06323 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PSME1Q06323 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PSME1Q06323 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
PSME1Q06323 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PSME1Q06323 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
PSME1Q06323 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PSME1Q06323 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PSME1Q06323 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PSME1Q06323 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PSME1Q06323 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PSME1Q06323 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PSME1Q06323 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PSME1Q06323 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PSME1Q06323 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PSME1Q06323 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PSME1Q06323 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PSME1Q06323 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PSME1Q06323 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PSME1Q06323 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PSME1Q06323 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PSME1Q06323 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PSME1Q06323 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PSME1Q06323 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PSME1Q06323 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PSME1Q06323 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PSME1Q06323 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PSME1Q06323 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PSME1Q06323 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PSME1Q06323 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PSME1Q06323 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PSME1Q06323 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PSME1Q06323 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
PSME1Q06323 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PSME1Q06323 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PSME1Q06323 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
PSME1Q06323 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
PSME1Q06323 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.89
PSME1Q06323 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
PSME1Q06323 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
PSME1Q06323 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.89
PSME1Q06323 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PSME1Q06323 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PSME1Q06323 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PSME1Q06323 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PSME1Q06323 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PSME1Q06323 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PSME1Q06323 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PSME1Q06323 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PSME1Q06323 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PSME1Q06323 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PSME1Q06323 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PSME1Q06323 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PSME1Q06323 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PSME1Q06323 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PSME1Q06323 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PSME1Q06323 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PSME1Q06323 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PSME1Q06323 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PSME1Q06323 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PSME1Q06323 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PSME1Q06323 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PSME1Q06323 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PSME1Q06323 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PSME1Q06323 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PSME1Q06323 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PSME1Q06323 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
PSME1Q06323 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PSME1Q06323 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PSME1Q06323 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PSME1Q06323 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PSME1Q06323 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PSME1Q06323 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PSME1Q06323 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PSME1Q06323 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PSME1Q06323 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PSME1Q06323 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PSME1Q06323 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PSME1Q06323 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PSME1Q06323 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
PSME1Q06323 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
PSME1Q06323 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
PSME1Q06323 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PSME1Q06323 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PSME1Q06323 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
PSME1Q06323 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PSME1Q06323 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PSME1Q06323 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PSME1Q06323 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PSME1Q06323 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PSME1Q06323 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PSME1Q06323 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PSME1Q06323 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PSME1Q06323 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms