Protein–RNA interactions for Protein: Q05940

SLC18A2, Synaptic vesicular amine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A2Q05940 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLC18A2Q05940 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLC18A2Q05940 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLC18A2Q05940 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLC18A2Q05940 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLC18A2Q05940 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLC18A2Q05940 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLC18A2Q05940 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLC18A2Q05940 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLC18A2Q05940 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLC18A2Q05940 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLC18A2Q05940 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLC18A2Q05940 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLC18A2Q05940 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLC18A2Q05940 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLC18A2Q05940 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLC18A2Q05940 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLC18A2Q05940 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLC18A2Q05940 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLC18A2Q05940 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLC18A2Q05940 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLC18A2Q05940 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLC18A2Q05940 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLC18A2Q05940 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLC18A2Q05940 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
SLC18A2Q05940 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLC18A2Q05940 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLC18A2Q05940 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLC18A2Q05940 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLC18A2Q05940 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLC18A2Q05940 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLC18A2Q05940 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLC18A2Q05940 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLC18A2Q05940 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLC18A2Q05940 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLC18A2Q05940 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
SLC18A2Q05940 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLC18A2Q05940 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLC18A2Q05940 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLC18A2Q05940 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLC18A2Q05940 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLC18A2Q05940 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLC18A2Q05940 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLC18A2Q05940 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLC18A2Q05940 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLC18A2Q05940 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLC18A2Q05940 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLC18A2Q05940 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLC18A2Q05940 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC18A2Q05940 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC18A2Q05940 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC18A2Q05940 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC18A2Q05940 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC18A2Q05940 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC18A2Q05940 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC18A2Q05940 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC18A2Q05940 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC18A2Q05940 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC18A2Q05940 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC18A2Q05940 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC18A2Q05940 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC18A2Q05940 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC18A2Q05940 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC18A2Q05940 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC18A2Q05940 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC18A2Q05940 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC18A2Q05940 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC18A2Q05940 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC18A2Q05940 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC18A2Q05940 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC18A2Q05940 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC18A2Q05940 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC18A2Q05940 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC18A2Q05940 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC18A2Q05940 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC18A2Q05940 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC18A2Q05940 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC18A2Q05940 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC18A2Q05940 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC18A2Q05940 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC18A2Q05940 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC18A2Q05940 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC18A2Q05940 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC18A2Q05940 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC18A2Q05940 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC18A2Q05940 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC18A2Q05940 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC18A2Q05940 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC18A2Q05940 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC18A2Q05940 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC18A2Q05940 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC18A2Q05940 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC18A2Q05940 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC18A2Q05940 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC18A2Q05940 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SLC18A2Q05940 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SLC18A2Q05940 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SLC18A2Q05940 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SLC18A2Q05940 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SLC18A2Q05940 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms