Protein–RNA interactions for Protein: Q05086

UBE3A, Ubiquitin-protein ligase E3A, humanhuman

Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3AQ05086 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
UBE3AQ05086 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
UBE3AQ05086 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
UBE3AQ05086 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
UBE3AQ05086 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
UBE3AQ05086 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
UBE3AQ05086 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
UBE3AQ05086 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
UBE3AQ05086 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
UBE3AQ05086 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
UBE3AQ05086 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
UBE3AQ05086 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
UBE3AQ05086 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC20.92■□□□□ 0.94
UBE3AQ05086 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
UBE3AQ05086 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
UBE3AQ05086 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
UBE3AQ05086 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
UBE3AQ05086 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
UBE3AQ05086 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
UBE3AQ05086 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
UBE3AQ05086 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
UBE3AQ05086 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
UBE3AQ05086 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
UBE3AQ05086 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
UBE3AQ05086 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
UBE3AQ05086 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
UBE3AQ05086 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
UBE3AQ05086 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
UBE3AQ05086 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
UBE3AQ05086 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
UBE3AQ05086 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
UBE3AQ05086 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
UBE3AQ05086 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
UBE3AQ05086 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
UBE3AQ05086 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
UBE3AQ05086 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
UBE3AQ05086 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
UBE3AQ05086 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
UBE3AQ05086 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
UBE3AQ05086 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
UBE3AQ05086 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
UBE3AQ05086 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
UBE3AQ05086 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
UBE3AQ05086 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
UBE3AQ05086 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
UBE3AQ05086 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
UBE3AQ05086 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
UBE3AQ05086 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
UBE3AQ05086 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
UBE3AQ05086 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
UBE3AQ05086 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
UBE3AQ05086 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
UBE3AQ05086 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
UBE3AQ05086 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
UBE3AQ05086 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
UBE3AQ05086 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
UBE3AQ05086 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
UBE3AQ05086 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
UBE3AQ05086 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
UBE3AQ05086 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
UBE3AQ05086 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
UBE3AQ05086 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
UBE3AQ05086 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
UBE3AQ05086 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
UBE3AQ05086 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
UBE3AQ05086 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
UBE3AQ05086 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
UBE3AQ05086 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
UBE3AQ05086 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
UBE3AQ05086 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
UBE3AQ05086 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
UBE3AQ05086 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
UBE3AQ05086 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
UBE3AQ05086 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
UBE3AQ05086 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
UBE3AQ05086 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
UBE3AQ05086 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
UBE3AQ05086 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
UBE3AQ05086 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
UBE3AQ05086 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
UBE3AQ05086 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.94
UBE3AQ05086 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
UBE3AQ05086 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
UBE3AQ05086 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
UBE3AQ05086 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
UBE3AQ05086 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
UBE3AQ05086 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
UBE3AQ05086 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
UBE3AQ05086 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC20.89■□□□□ 0.93
UBE3AQ05086 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
UBE3AQ05086 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
UBE3AQ05086 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
UBE3AQ05086 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
UBE3AQ05086 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
UBE3AQ05086 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
UBE3AQ05086 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC20.89■□□□□ 0.93
UBE3AQ05086 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
UBE3AQ05086 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
UBE3AQ05086 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
UBE3AQ05086 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms