Protein–RNA interactions for Protein: Q04656

ATP7A, Copper-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7AQ04656 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
ATP7AQ04656 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
ATP7AQ04656 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
ATP7AQ04656 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
ATP7AQ04656 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
ATP7AQ04656 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
ATP7AQ04656 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
ATP7AQ04656 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
ATP7AQ04656 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
ATP7AQ04656 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
ATP7AQ04656 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
ATP7AQ04656 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
ATP7AQ04656 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
ATP7AQ04656 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
ATP7AQ04656 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
ATP7AQ04656 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
ATP7AQ04656 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
ATP7AQ04656 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
ATP7AQ04656 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
ATP7AQ04656 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
ATP7AQ04656 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.41■■■□□ 2.3
ATP7AQ04656 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
ATP7AQ04656 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
ATP7AQ04656 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
ATP7AQ04656 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC29.41■■■□□ 2.3
ATP7AQ04656 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
ATP7AQ04656 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
ATP7AQ04656 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
ATP7AQ04656 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
ATP7AQ04656 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
ATP7AQ04656 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
ATP7AQ04656 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
ATP7AQ04656 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
ATP7AQ04656 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
ATP7AQ04656 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
ATP7AQ04656 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
ATP7AQ04656 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
ATP7AQ04656 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
ATP7AQ04656 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
ATP7AQ04656 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
ATP7AQ04656 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
ATP7AQ04656 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
ATP7AQ04656 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
ATP7AQ04656 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
ATP7AQ04656 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
ATP7AQ04656 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
ATP7AQ04656 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
ATP7AQ04656 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
ATP7AQ04656 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
ATP7AQ04656 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
ATP7AQ04656 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
ATP7AQ04656 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
ATP7AQ04656 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
ATP7AQ04656 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
ATP7AQ04656 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC29.39■■■□□ 2.3
ATP7AQ04656 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
ATP7AQ04656 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
ATP7AQ04656 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
ATP7AQ04656 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
ATP7AQ04656 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
ATP7AQ04656 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC29.39■■■□□ 2.3
ATP7AQ04656 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
ATP7AQ04656 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
ATP7AQ04656 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
ATP7AQ04656 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.29
ATP7AQ04656 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
ATP7AQ04656 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
ATP7AQ04656 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
ATP7AQ04656 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
ATP7AQ04656 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
ATP7AQ04656 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
ATP7AQ04656 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
ATP7AQ04656 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
ATP7AQ04656 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
ATP7AQ04656 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
ATP7AQ04656 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
ATP7AQ04656 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
ATP7AQ04656 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
ATP7AQ04656 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
ATP7AQ04656 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
ATP7AQ04656 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
ATP7AQ04656 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
ATP7AQ04656 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
ATP7AQ04656 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
ATP7AQ04656 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
ATP7AQ04656 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
ATP7AQ04656 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
ATP7AQ04656 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
ATP7AQ04656 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
ATP7AQ04656 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
ATP7AQ04656 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
ATP7AQ04656 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
ATP7AQ04656 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
ATP7AQ04656 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
ATP7AQ04656 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
ATP7AQ04656 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC29.36■■■□□ 2.29
ATP7AQ04656 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
ATP7AQ04656 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
ATP7AQ04656 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
ATP7AQ04656 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms