Protein–RNA interactions for Protein: Q04323

UBXN1, UBX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN1Q04323 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
UBXN1Q04323 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
UBXN1Q04323 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
UBXN1Q04323 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
UBXN1Q04323 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
UBXN1Q04323 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
UBXN1Q04323 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
UBXN1Q04323 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
UBXN1Q04323 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
UBXN1Q04323 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
UBXN1Q04323 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
UBXN1Q04323 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
UBXN1Q04323 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
UBXN1Q04323 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
UBXN1Q04323 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBXN1Q04323 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBXN1Q04323 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBXN1Q04323 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBXN1Q04323 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBXN1Q04323 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBXN1Q04323 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBXN1Q04323 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
UBXN1Q04323 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBXN1Q04323 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBXN1Q04323 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBXN1Q04323 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBXN1Q04323 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBXN1Q04323 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBXN1Q04323 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBXN1Q04323 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBXN1Q04323 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBXN1Q04323 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBXN1Q04323 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
UBXN1Q04323 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBXN1Q04323 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
UBXN1Q04323 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBXN1Q04323 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBXN1Q04323 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBXN1Q04323 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
UBXN1Q04323 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBXN1Q04323 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBXN1Q04323 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBXN1Q04323 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBXN1Q04323 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBXN1Q04323 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBXN1Q04323 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBXN1Q04323 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBXN1Q04323 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBXN1Q04323 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBXN1Q04323 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBXN1Q04323 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBXN1Q04323 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBXN1Q04323 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBXN1Q04323 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBXN1Q04323 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBXN1Q04323 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBXN1Q04323 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBXN1Q04323 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBXN1Q04323 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBXN1Q04323 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBXN1Q04323 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBXN1Q04323 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBXN1Q04323 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBXN1Q04323 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBXN1Q04323 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBXN1Q04323 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBXN1Q04323 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBXN1Q04323 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBXN1Q04323 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBXN1Q04323 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBXN1Q04323 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBXN1Q04323 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBXN1Q04323 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
UBXN1Q04323 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBXN1Q04323 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBXN1Q04323 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
UBXN1Q04323 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBXN1Q04323 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBXN1Q04323 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBXN1Q04323 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBXN1Q04323 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBXN1Q04323 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBXN1Q04323 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBXN1Q04323 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBXN1Q04323 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBXN1Q04323 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBXN1Q04323 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBXN1Q04323 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBXN1Q04323 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBXN1Q04323 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBXN1Q04323 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
UBXN1Q04323 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBXN1Q04323 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBXN1Q04323 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBXN1Q04323 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBXN1Q04323 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBXN1Q04323 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBXN1Q04323 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBXN1Q04323 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBXN1Q04323 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms