Protein–RNA interactions for Protein: Q03721

KCNC4, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 4, humanhuman

Predictions only

Length 635 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNC4Q03721 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KCNC4Q03721 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KCNC4Q03721 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KCNC4Q03721 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
KCNC4Q03721 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
KCNC4Q03721 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
KCNC4Q03721 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KCNC4Q03721 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KCNC4Q03721 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KCNC4Q03721 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KCNC4Q03721 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
KCNC4Q03721 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KCNC4Q03721 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
KCNC4Q03721 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC19■□□□□ 0.63
KCNC4Q03721 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KCNC4Q03721 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KCNC4Q03721 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC19■□□□□ 0.63
KCNC4Q03721 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KCNC4Q03721 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KCNC4Q03721 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
KCNC4Q03721 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
KCNC4Q03721 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
KCNC4Q03721 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
KCNC4Q03721 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
KCNC4Q03721 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
KCNC4Q03721 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
KCNC4Q03721 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
KCNC4Q03721 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
KCNC4Q03721 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
KCNC4Q03721 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
KCNC4Q03721 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
KCNC4Q03721 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
KCNC4Q03721 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
KCNC4Q03721 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
KCNC4Q03721 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
KCNC4Q03721 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
KCNC4Q03721 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
KCNC4Q03721 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
KCNC4Q03721 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
KCNC4Q03721 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
KCNC4Q03721 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
KCNC4Q03721 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
KCNC4Q03721 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
KCNC4Q03721 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
KCNC4Q03721 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
KCNC4Q03721 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
KCNC4Q03721 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KCNC4Q03721 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KCNC4Q03721 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
KCNC4Q03721 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KCNC4Q03721 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
KCNC4Q03721 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
KCNC4Q03721 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KCNC4Q03721 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
KCNC4Q03721 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KCNC4Q03721 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KCNC4Q03721 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KCNC4Q03721 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
KCNC4Q03721 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KCNC4Q03721 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KCNC4Q03721 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
KCNC4Q03721 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
KCNC4Q03721 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
KCNC4Q03721 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KCNC4Q03721 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
KCNC4Q03721 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
KCNC4Q03721 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KCNC4Q03721 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
KCNC4Q03721 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KCNC4Q03721 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KCNC4Q03721 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KCNC4Q03721 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KCNC4Q03721 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KCNC4Q03721 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KCNC4Q03721 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KCNC4Q03721 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KCNC4Q03721 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KCNC4Q03721 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KCNC4Q03721 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KCNC4Q03721 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KCNC4Q03721 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KCNC4Q03721 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KCNC4Q03721 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KCNC4Q03721 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
KCNC4Q03721 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KCNC4Q03721 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
KCNC4Q03721 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KCNC4Q03721 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KCNC4Q03721 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KCNC4Q03721 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KCNC4Q03721 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KCNC4Q03721 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KCNC4Q03721 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KCNC4Q03721 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KCNC4Q03721 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KCNC4Q03721 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KCNC4Q03721 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KCNC4Q03721 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KCNC4Q03721 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KCNC4Q03721 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms