Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CACNB1Q02641 FP565260.4-201ENST00000624081 513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CACNB1Q02641 LINC01709-202ENST00000635702 1204 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CACNB1Q02641 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CACNB1Q02641 AC006927.2-201ENST00000639256 389 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CACNB1Q02641 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CACNB1Q02641 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CACNB1Q02641 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CACNB1Q02641 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CACNB1Q02641 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CACNB1Q02641 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CACNB1Q02641 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CACNB1Q02641 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CACNB1Q02641 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CACNB1Q02641 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CACNB1Q02641 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CACNB1Q02641 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CACNB1Q02641 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CACNB1Q02641 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CACNB1Q02641 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CACNB1Q02641 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CACNB1Q02641 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CACNB1Q02641 AL357172.1-201ENST00000556016 593 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CACNB1Q02641 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CACNB1Q02641 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CACNB1Q02641 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CACNB1Q02641 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CACNB1Q02641 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CACNB1Q02641 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CACNB1Q02641 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CACNB1Q02641 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CACNB1Q02641 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CACNB1Q02641 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CACNB1Q02641 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CACNB1Q02641 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CACNB1Q02641 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CACNB1Q02641 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CACNB1Q02641 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CACNB1Q02641 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CACNB1Q02641 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CACNB1Q02641 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CACNB1Q02641 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CACNB1Q02641 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CACNB1Q02641 TCEAL8-202ENST00000372685 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CACNB1Q02641 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CACNB1Q02641 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CACNB1Q02641 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CACNB1Q02641 AC011451.1-201ENST00000591336 405 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CACNB1Q02641 ZNF667-AS1-209ENST00000601875 495 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CACNB1Q02641 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CACNB1Q02641 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CACNB1Q02641 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CACNB1Q02641 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CACNB1Q02641 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CACNB1Q02641 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CACNB1Q02641 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CACNB1Q02641 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CACNB1Q02641 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CACNB1Q02641 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CACNB1Q02641 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CACNB1Q02641 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CACNB1Q02641 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CACNB1Q02641 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CACNB1Q02641 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CACNB1Q02641 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CACNB1Q02641 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CACNB1Q02641 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CACNB1Q02641 AC016550.1-201ENST00000505348 785 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CACNB1Q02641 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CACNB1Q02641 C16orf52-205ENST00000567004 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CACNB1Q02641 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CACNB1Q02641 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CACNB1Q02641 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CACNB1Q02641 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CACNB1Q02641 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CACNB1Q02641 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CACNB1Q02641 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CACNB1Q02641 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CACNB1Q02641 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CACNB1Q02641 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CACNB1Q02641 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CACNB1Q02641 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CACNB1Q02641 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CACNB1Q02641 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CACNB1Q02641 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CACNB1Q02641 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CACNB1Q02641 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CACNB1Q02641 MTND1P26-201ENST00000440488 538 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CACNB1Q02641 CXCL11-202ENST00000503860 767 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CACNB1Q02641 AC009268.1-201ENST00000561352 1203 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CACNB1Q02641 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CACNB1Q02641 AC090371.2-202ENST00000582239 644 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CACNB1Q02641 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CACNB1Q02641 AC146944.4-201ENST00000602697 718 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CACNB1Q02641 AC097376.1-201ENST00000602907 997 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CACNB1Q02641 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CACNB1Q02641 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CACNB1Q02641 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CACNB1Q02641 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CACNB1Q02641 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms