Protein–RNA interactions for Protein: Q02487

DSC2, Desmocollin-2, humanhuman

Predictions only

Length 901 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC2Q02487 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DSC2Q02487 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DSC2Q02487 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
DSC2Q02487 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DSC2Q02487 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DSC2Q02487 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DSC2Q02487 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DSC2Q02487 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DSC2Q02487 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
DSC2Q02487 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
DSC2Q02487 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DSC2Q02487 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
DSC2Q02487 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DSC2Q02487 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
DSC2Q02487 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DSC2Q02487 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
DSC2Q02487 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DSC2Q02487 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DSC2Q02487 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DSC2Q02487 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
DSC2Q02487 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DSC2Q02487 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DSC2Q02487 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
DSC2Q02487 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
DSC2Q02487 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
DSC2Q02487 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
DSC2Q02487 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
DSC2Q02487 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
DSC2Q02487 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
DSC2Q02487 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
DSC2Q02487 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
DSC2Q02487 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
DSC2Q02487 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
DSC2Q02487 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
DSC2Q02487 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
DSC2Q02487 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
DSC2Q02487 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
DSC2Q02487 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
DSC2Q02487 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
DSC2Q02487 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
DSC2Q02487 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
DSC2Q02487 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
DSC2Q02487 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
DSC2Q02487 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
DSC2Q02487 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
DSC2Q02487 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
DSC2Q02487 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
DSC2Q02487 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
DSC2Q02487 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
DSC2Q02487 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
DSC2Q02487 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
DSC2Q02487 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
DSC2Q02487 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
DSC2Q02487 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
DSC2Q02487 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
DSC2Q02487 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
DSC2Q02487 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
DSC2Q02487 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
DSC2Q02487 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
DSC2Q02487 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
DSC2Q02487 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
DSC2Q02487 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
DSC2Q02487 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
DSC2Q02487 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
DSC2Q02487 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
DSC2Q02487 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
DSC2Q02487 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
DSC2Q02487 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
DSC2Q02487 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
DSC2Q02487 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
DSC2Q02487 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
DSC2Q02487 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
DSC2Q02487 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
DSC2Q02487 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
DSC2Q02487 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
DSC2Q02487 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
DSC2Q02487 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
DSC2Q02487 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
DSC2Q02487 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
DSC2Q02487 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
DSC2Q02487 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
DSC2Q02487 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
DSC2Q02487 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
DSC2Q02487 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
DSC2Q02487 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
DSC2Q02487 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
DSC2Q02487 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
DSC2Q02487 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
DSC2Q02487 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
DSC2Q02487 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
DSC2Q02487 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
DSC2Q02487 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
DSC2Q02487 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
DSC2Q02487 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
DSC2Q02487 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
DSC2Q02487 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
DSC2Q02487 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
DSC2Q02487 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
DSC2Q02487 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
DSC2Q02487 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms