Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CENPEQ02224 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CENPEQ02224 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CENPEQ02224 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CENPEQ02224 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CENPEQ02224 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
CENPEQ02224 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CENPEQ02224 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CENPEQ02224 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CENPEQ02224 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CENPEQ02224 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CENPEQ02224 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CENPEQ02224 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CENPEQ02224 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CENPEQ02224 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
CENPEQ02224 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CENPEQ02224 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CENPEQ02224 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CENPEQ02224 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CENPEQ02224 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CENPEQ02224 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CENPEQ02224 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CENPEQ02224 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CENPEQ02224 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CENPEQ02224 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CENPEQ02224 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CENPEQ02224 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
CENPEQ02224 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CENPEQ02224 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CENPEQ02224 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CENPEQ02224 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CENPEQ02224 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CENPEQ02224 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CENPEQ02224 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CENPEQ02224 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CENPEQ02224 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
CENPEQ02224 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CENPEQ02224 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CENPEQ02224 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CENPEQ02224 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CENPEQ02224 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CENPEQ02224 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CENPEQ02224 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CENPEQ02224 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CENPEQ02224 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CENPEQ02224 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CENPEQ02224 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CENPEQ02224 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CENPEQ02224 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CENPEQ02224 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CENPEQ02224 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CENPEQ02224 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CENPEQ02224 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CENPEQ02224 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CENPEQ02224 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CENPEQ02224 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CENPEQ02224 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CENPEQ02224 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CENPEQ02224 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CENPEQ02224 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CENPEQ02224 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CENPEQ02224 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CENPEQ02224 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CENPEQ02224 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CENPEQ02224 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CENPEQ02224 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CENPEQ02224 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CENPEQ02224 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CENPEQ02224 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CENPEQ02224 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CENPEQ02224 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CENPEQ02224 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CENPEQ02224 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CENPEQ02224 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CENPEQ02224 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CENPEQ02224 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CENPEQ02224 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CENPEQ02224 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CENPEQ02224 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CENPEQ02224 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CENPEQ02224 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CENPEQ02224 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CENPEQ02224 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CENPEQ02224 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CENPEQ02224 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CENPEQ02224 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CENPEQ02224 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CENPEQ02224 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CENPEQ02224 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CENPEQ02224 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CENPEQ02224 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CENPEQ02224 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CENPEQ02224 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CENPEQ02224 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CENPEQ02224 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CENPEQ02224 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CENPEQ02224 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CENPEQ02224 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CENPEQ02224 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CENPEQ02224 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms