Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT1

PRCD, Progressive rod-cone degeneration protein, humanhuman

Predictions only

Length 54 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRCDQ00LT1 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRCDQ00LT1 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRCDQ00LT1 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRCDQ00LT1 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRCDQ00LT1 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRCDQ00LT1 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRCDQ00LT1 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRCDQ00LT1 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRCDQ00LT1 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRCDQ00LT1 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRCDQ00LT1 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRCDQ00LT1 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRCDQ00LT1 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRCDQ00LT1 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRCDQ00LT1 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PRCDQ00LT1 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRCDQ00LT1 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRCDQ00LT1 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRCDQ00LT1 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRCDQ00LT1 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRCDQ00LT1 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRCDQ00LT1 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRCDQ00LT1 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRCDQ00LT1 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRCDQ00LT1 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRCDQ00LT1 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRCDQ00LT1 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRCDQ00LT1 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRCDQ00LT1 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRCDQ00LT1 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRCDQ00LT1 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRCDQ00LT1 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRCDQ00LT1 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRCDQ00LT1 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRCDQ00LT1 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRCDQ00LT1 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRCDQ00LT1 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRCDQ00LT1 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRCDQ00LT1 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PRCDQ00LT1 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PRCDQ00LT1 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRCDQ00LT1 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRCDQ00LT1 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRCDQ00LT1 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRCDQ00LT1 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRCDQ00LT1 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRCDQ00LT1 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
PRCDQ00LT1 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRCDQ00LT1 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRCDQ00LT1 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRCDQ00LT1 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRCDQ00LT1 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
PRCDQ00LT1 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRCDQ00LT1 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRCDQ00LT1 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRCDQ00LT1 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRCDQ00LT1 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRCDQ00LT1 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRCDQ00LT1 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRCDQ00LT1 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRCDQ00LT1 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRCDQ00LT1 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRCDQ00LT1 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRCDQ00LT1 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRCDQ00LT1 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRCDQ00LT1 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRCDQ00LT1 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRCDQ00LT1 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PRCDQ00LT1 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PRCDQ00LT1 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PRCDQ00LT1 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PRCDQ00LT1 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PRCDQ00LT1 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PRCDQ00LT1 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
PRCDQ00LT1 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PRCDQ00LT1 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PRCDQ00LT1 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PRCDQ00LT1 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PRCDQ00LT1 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PRCDQ00LT1 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PRCDQ00LT1 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PRCDQ00LT1 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PRCDQ00LT1 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PRCDQ00LT1 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PRCDQ00LT1 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PRCDQ00LT1 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PRCDQ00LT1 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PRCDQ00LT1 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PRCDQ00LT1 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PRCDQ00LT1 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PRCDQ00LT1 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PRCDQ00LT1 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PRCDQ00LT1 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PRCDQ00LT1 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PRCDQ00LT1 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PRCDQ00LT1 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PRCDQ00LT1 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PRCDQ00LT1 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PRCDQ00LT1 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PRCDQ00LT1 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms