Protein–RNA interactions for Protein: Q00341

HDLBP, Vigilin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBPQ00341 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HDLBPQ00341 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HDLBPQ00341 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HDLBPQ00341 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HDLBPQ00341 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HDLBPQ00341 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
HDLBPQ00341 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HDLBPQ00341 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HDLBPQ00341 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HDLBPQ00341 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HDLBPQ00341 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HDLBPQ00341 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HDLBPQ00341 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HDLBPQ00341 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HDLBPQ00341 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HDLBPQ00341 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HDLBPQ00341 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HDLBPQ00341 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HDLBPQ00341 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HDLBPQ00341 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HDLBPQ00341 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HDLBPQ00341 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HDLBPQ00341 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
HDLBPQ00341 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HDLBPQ00341 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HDLBPQ00341 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HDLBPQ00341 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HDLBPQ00341 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HDLBPQ00341 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HDLBPQ00341 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
HDLBPQ00341 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HDLBPQ00341 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
HDLBPQ00341 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HDLBPQ00341 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HDLBPQ00341 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HDLBPQ00341 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HDLBPQ00341 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HDLBPQ00341 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HDLBPQ00341 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HDLBPQ00341 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HDLBPQ00341 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HDLBPQ00341 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HDLBPQ00341 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HDLBPQ00341 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HDLBPQ00341 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HDLBPQ00341 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HDLBPQ00341 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HDLBPQ00341 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HDLBPQ00341 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HDLBPQ00341 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HDLBPQ00341 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HDLBPQ00341 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HDLBPQ00341 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HDLBPQ00341 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HDLBPQ00341 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HDLBPQ00341 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HDLBPQ00341 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HDLBPQ00341 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HDLBPQ00341 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HDLBPQ00341 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HDLBPQ00341 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HDLBPQ00341 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HDLBPQ00341 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HDLBPQ00341 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HDLBPQ00341 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.35
HDLBPQ00341 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HDLBPQ00341 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HDLBPQ00341 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HDLBPQ00341 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HDLBPQ00341 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HDLBPQ00341 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HDLBPQ00341 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HDLBPQ00341 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HDLBPQ00341 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
HDLBPQ00341 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HDLBPQ00341 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HDLBPQ00341 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HDLBPQ00341 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
HDLBPQ00341 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HDLBPQ00341 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
HDLBPQ00341 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HDLBPQ00341 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HDLBPQ00341 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
HDLBPQ00341 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HDLBPQ00341 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HDLBPQ00341 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HDLBPQ00341 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HDLBPQ00341 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HDLBPQ00341 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HDLBPQ00341 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HDLBPQ00341 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HDLBPQ00341 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HDLBPQ00341 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HDLBPQ00341 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HDLBPQ00341 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HDLBPQ00341 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HDLBPQ00341 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
HDLBPQ00341 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HDLBPQ00341 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HDLBPQ00341 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms