Protein–RNA interactions for Protein: Q00059

TFAM, Transcription factor A, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAMQ00059 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TFAMQ00059 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TFAMQ00059 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
TFAMQ00059 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TFAMQ00059 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TFAMQ00059 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TFAMQ00059 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TFAMQ00059 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TFAMQ00059 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TFAMQ00059 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TFAMQ00059 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TFAMQ00059 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TFAMQ00059 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TFAMQ00059 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TFAMQ00059 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TFAMQ00059 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TFAMQ00059 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TFAMQ00059 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TFAMQ00059 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TFAMQ00059 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC21.33■■□□□ 1
TFAMQ00059 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TFAMQ00059 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TFAMQ00059 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TFAMQ00059 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TFAMQ00059 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TFAMQ00059 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TFAMQ00059 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TFAMQ00059 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TFAMQ00059 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TFAMQ00059 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TFAMQ00059 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TFAMQ00059 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TFAMQ00059 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TFAMQ00059 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TFAMQ00059 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TFAMQ00059 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TFAMQ00059 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TFAMQ00059 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TFAMQ00059 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TFAMQ00059 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TFAMQ00059 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TFAMQ00059 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TFAMQ00059 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TFAMQ00059 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TFAMQ00059 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TFAMQ00059 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TFAMQ00059 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TFAMQ00059 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TFAMQ00059 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TFAMQ00059 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TFAMQ00059 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TFAMQ00059 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TFAMQ00059 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TFAMQ00059 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TFAMQ00059 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TFAMQ00059 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TFAMQ00059 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TFAMQ00059 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TFAMQ00059 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
TFAMQ00059 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TFAMQ00059 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TFAMQ00059 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
TFAMQ00059 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TFAMQ00059 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TFAMQ00059 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TFAMQ00059 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TFAMQ00059 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TFAMQ00059 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TFAMQ00059 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
TFAMQ00059 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TFAMQ00059 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
TFAMQ00059 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TFAMQ00059 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TFAMQ00059 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TFAMQ00059 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
TFAMQ00059 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
TFAMQ00059 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TFAMQ00059 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TFAMQ00059 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
TFAMQ00059 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TFAMQ00059 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
TFAMQ00059 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TFAMQ00059 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
TFAMQ00059 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TFAMQ00059 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TFAMQ00059 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TFAMQ00059 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TFAMQ00059 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TFAMQ00059 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TFAMQ00059 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TFAMQ00059 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TFAMQ00059 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TFAMQ00059 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TFAMQ00059 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TFAMQ00059 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TFAMQ00059 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TFAMQ00059 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TFAMQ00059 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TFAMQ00059 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TFAMQ00059 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms