Protein–RNA interactions for Protein: P98194

ATP2C1, Calcium-transporting ATPase type 2C member 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2C1P98194 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP2C1P98194 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP2C1P98194 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP2C1P98194 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP2C1P98194 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP2C1P98194 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP2C1P98194 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP2C1P98194 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP2C1P98194 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP2C1P98194 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP2C1P98194 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP2C1P98194 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP2C1P98194 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP2C1P98194 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP2C1P98194 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP2C1P98194 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP2C1P98194 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP2C1P98194 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP2C1P98194 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP2C1P98194 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP2C1P98194 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP2C1P98194 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP2C1P98194 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP2C1P98194 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP2C1P98194 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP2C1P98194 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP2C1P98194 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP2C1P98194 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP2C1P98194 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP2C1P98194 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP2C1P98194 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP2C1P98194 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP2C1P98194 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP2C1P98194 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP2C1P98194 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP2C1P98194 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP2C1P98194 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP2C1P98194 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
ATP2C1P98194 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP2C1P98194 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP2C1P98194 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP2C1P98194 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP2C1P98194 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP2C1P98194 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP2C1P98194 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP2C1P98194 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP2C1P98194 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP2C1P98194 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP2C1P98194 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP2C1P98194 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP2C1P98194 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP2C1P98194 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP2C1P98194 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP2C1P98194 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP2C1P98194 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP2C1P98194 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP2C1P98194 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP2C1P98194 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP2C1P98194 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP2C1P98194 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP2C1P98194 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP2C1P98194 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP2C1P98194 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP2C1P98194 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP2C1P98194 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP2C1P98194 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP2C1P98194 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP2C1P98194 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP2C1P98194 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP2C1P98194 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP2C1P98194 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP2C1P98194 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP2C1P98194 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP2C1P98194 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP2C1P98194 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP2C1P98194 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP2C1P98194 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP2C1P98194 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP2C1P98194 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP2C1P98194 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP2C1P98194 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP2C1P98194 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP2C1P98194 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP2C1P98194 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP2C1P98194 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP2C1P98194 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP2C1P98194 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP2C1P98194 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP2C1P98194 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP2C1P98194 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP2C1P98194 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP2C1P98194 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP2C1P98194 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP2C1P98194 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP2C1P98194 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP2C1P98194 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP2C1P98194 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP2C1P98194 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP2C1P98194 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP2C1P98194 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms