Protein–RNA interactions for Protein: P98177

FOXO4, Forkhead box protein O4, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO4P98177 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
FOXO4P98177 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FOXO4P98177 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FOXO4P98177 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FOXO4P98177 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FOXO4P98177 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FOXO4P98177 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FOXO4P98177 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FOXO4P98177 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FOXO4P98177 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FOXO4P98177 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FOXO4P98177 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FOXO4P98177 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FOXO4P98177 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FOXO4P98177 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FOXO4P98177 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FOXO4P98177 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FOXO4P98177 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FOXO4P98177 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FOXO4P98177 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FOXO4P98177 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FOXO4P98177 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FOXO4P98177 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FOXO4P98177 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FOXO4P98177 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FOXO4P98177 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FOXO4P98177 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FOXO4P98177 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FOXO4P98177 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FOXO4P98177 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FOXO4P98177 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FOXO4P98177 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FOXO4P98177 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FOXO4P98177 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FOXO4P98177 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FOXO4P98177 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FOXO4P98177 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FOXO4P98177 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FOXO4P98177 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
FOXO4P98177 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FOXO4P98177 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FOXO4P98177 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FOXO4P98177 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FOXO4P98177 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FOXO4P98177 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FOXO4P98177 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FOXO4P98177 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FOXO4P98177 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
FOXO4P98177 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FOXO4P98177 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FOXO4P98177 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FOXO4P98177 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
FOXO4P98177 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
FOXO4P98177 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FOXO4P98177 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FOXO4P98177 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FOXO4P98177 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FOXO4P98177 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FOXO4P98177 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FOXO4P98177 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FOXO4P98177 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FOXO4P98177 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FOXO4P98177 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FOXO4P98177 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FOXO4P98177 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FOXO4P98177 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FOXO4P98177 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FOXO4P98177 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FOXO4P98177 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
FOXO4P98177 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FOXO4P98177 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FOXO4P98177 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FOXO4P98177 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
FOXO4P98177 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FOXO4P98177 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FOXO4P98177 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FOXO4P98177 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FOXO4P98177 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FOXO4P98177 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FOXO4P98177 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FOXO4P98177 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FOXO4P98177 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FOXO4P98177 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FOXO4P98177 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FOXO4P98177 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FOXO4P98177 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FOXO4P98177 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FOXO4P98177 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
FOXO4P98177 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FOXO4P98177 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FOXO4P98177 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FOXO4P98177 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
FOXO4P98177 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
FOXO4P98177 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
FOXO4P98177 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
FOXO4P98177 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
FOXO4P98177 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
FOXO4P98177 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
FOXO4P98177 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
FOXO4P98177 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms