Protein–RNA interactions for Protein: P86397

HTD2, Hydroxyacyl-thioester dehydratase type 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTD2P86397 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HTD2P86397 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HTD2P86397 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HTD2P86397 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HTD2P86397 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HTD2P86397 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HTD2P86397 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HTD2P86397 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HTD2P86397 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
HTD2P86397 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HTD2P86397 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HTD2P86397 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HTD2P86397 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HTD2P86397 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HTD2P86397 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HTD2P86397 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HTD2P86397 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HTD2P86397 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HTD2P86397 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HTD2P86397 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HTD2P86397 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HTD2P86397 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HTD2P86397 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HTD2P86397 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HTD2P86397 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HTD2P86397 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HTD2P86397 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HTD2P86397 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HTD2P86397 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HTD2P86397 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HTD2P86397 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HTD2P86397 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HTD2P86397 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HTD2P86397 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HTD2P86397 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HTD2P86397 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HTD2P86397 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HTD2P86397 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HTD2P86397 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HTD2P86397 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HTD2P86397 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HTD2P86397 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HTD2P86397 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HTD2P86397 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HTD2P86397 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HTD2P86397 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HTD2P86397 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HTD2P86397 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HTD2P86397 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
HTD2P86397 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HTD2P86397 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
HTD2P86397 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HTD2P86397 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HTD2P86397 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HTD2P86397 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HTD2P86397 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
HTD2P86397 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HTD2P86397 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HTD2P86397 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HTD2P86397 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HTD2P86397 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HTD2P86397 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HTD2P86397 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HTD2P86397 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HTD2P86397 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HTD2P86397 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HTD2P86397 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HTD2P86397 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HTD2P86397 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HTD2P86397 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HTD2P86397 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HTD2P86397 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
HTD2P86397 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HTD2P86397 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HTD2P86397 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HTD2P86397 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HTD2P86397 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HTD2P86397 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HTD2P86397 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HTD2P86397 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HTD2P86397 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HTD2P86397 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HTD2P86397 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HTD2P86397 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HTD2P86397 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HTD2P86397 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HTD2P86397 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HTD2P86397 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HTD2P86397 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HTD2P86397 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HTD2P86397 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HTD2P86397 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HTD2P86397 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HTD2P86397 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HTD2P86397 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
HTD2P86397 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
HTD2P86397 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HTD2P86397 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HTD2P86397 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HTD2P86397 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms