Protein–RNA interactions for Protein: P78415

IRX3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX3P78415 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
IRX3P78415 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
IRX3P78415 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IRX3P78415 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IRX3P78415 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
IRX3P78415 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IRX3P78415 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IRX3P78415 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
IRX3P78415 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
IRX3P78415 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
IRX3P78415 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IRX3P78415 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
IRX3P78415 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IRX3P78415 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
IRX3P78415 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
IRX3P78415 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
IRX3P78415 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
IRX3P78415 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
IRX3P78415 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
IRX3P78415 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
IRX3P78415 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
IRX3P78415 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
IRX3P78415 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
IRX3P78415 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
IRX3P78415 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
IRX3P78415 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
IRX3P78415 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
IRX3P78415 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
IRX3P78415 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
IRX3P78415 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
IRX3P78415 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
IRX3P78415 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
IRX3P78415 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
IRX3P78415 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
IRX3P78415 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
IRX3P78415 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
IRX3P78415 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
IRX3P78415 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
IRX3P78415 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
IRX3P78415 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
IRX3P78415 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
IRX3P78415 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
IRX3P78415 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
IRX3P78415 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
IRX3P78415 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
IRX3P78415 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
IRX3P78415 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
IRX3P78415 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
IRX3P78415 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
IRX3P78415 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
IRX3P78415 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
IRX3P78415 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
IRX3P78415 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
IRX3P78415 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
IRX3P78415 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
IRX3P78415 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
IRX3P78415 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
IRX3P78415 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
IRX3P78415 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
IRX3P78415 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
IRX3P78415 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
IRX3P78415 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
IRX3P78415 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
IRX3P78415 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
IRX3P78415 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
IRX3P78415 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
IRX3P78415 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
IRX3P78415 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
IRX3P78415 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
IRX3P78415 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
IRX3P78415 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
IRX3P78415 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
IRX3P78415 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
IRX3P78415 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
IRX3P78415 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
IRX3P78415 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
IRX3P78415 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
IRX3P78415 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
IRX3P78415 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
IRX3P78415 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
IRX3P78415 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
IRX3P78415 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
IRX3P78415 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
IRX3P78415 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
IRX3P78415 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
IRX3P78415 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
IRX3P78415 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
IRX3P78415 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
IRX3P78415 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
IRX3P78415 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
IRX3P78415 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
IRX3P78415 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
IRX3P78415 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
IRX3P78415 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
IRX3P78415 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
IRX3P78415 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
IRX3P78415 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
IRX3P78415 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
IRX3P78415 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
IRX3P78415 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms