Protein–RNA interactions for Protein: P78348

ASIC1, Acid-sensing ion channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASIC1P78348 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
ASIC1P78348 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ASIC1P78348 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ASIC1P78348 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ASIC1P78348 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ASIC1P78348 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ASIC1P78348 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ASIC1P78348 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ASIC1P78348 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ASIC1P78348 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ASIC1P78348 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ASIC1P78348 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ASIC1P78348 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ASIC1P78348 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ASIC1P78348 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ASIC1P78348 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ASIC1P78348 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ASIC1P78348 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ASIC1P78348 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ASIC1P78348 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ASIC1P78348 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ASIC1P78348 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ASIC1P78348 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ASIC1P78348 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ASIC1P78348 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ASIC1P78348 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ASIC1P78348 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ASIC1P78348 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ASIC1P78348 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ASIC1P78348 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ASIC1P78348 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ASIC1P78348 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ASIC1P78348 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ASIC1P78348 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ASIC1P78348 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ASIC1P78348 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ASIC1P78348 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ASIC1P78348 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ASIC1P78348 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ASIC1P78348 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ASIC1P78348 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ASIC1P78348 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ASIC1P78348 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ASIC1P78348 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ASIC1P78348 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ASIC1P78348 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ASIC1P78348 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ASIC1P78348 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ASIC1P78348 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ASIC1P78348 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ASIC1P78348 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ASIC1P78348 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ASIC1P78348 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ASIC1P78348 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ASIC1P78348 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ASIC1P78348 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ASIC1P78348 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ASIC1P78348 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ASIC1P78348 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ASIC1P78348 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ASIC1P78348 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ASIC1P78348 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ASIC1P78348 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ASIC1P78348 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ASIC1P78348 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ASIC1P78348 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ASIC1P78348 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ASIC1P78348 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ASIC1P78348 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ASIC1P78348 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ASIC1P78348 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ASIC1P78348 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ASIC1P78348 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ASIC1P78348 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ASIC1P78348 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ASIC1P78348 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ASIC1P78348 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ASIC1P78348 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ASIC1P78348 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ASIC1P78348 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ASIC1P78348 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ASIC1P78348 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ASIC1P78348 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ASIC1P78348 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ASIC1P78348 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ASIC1P78348 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ASIC1P78348 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ASIC1P78348 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ASIC1P78348 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ASIC1P78348 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ASIC1P78348 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ASIC1P78348 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ASIC1P78348 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ASIC1P78348 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ASIC1P78348 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ASIC1P78348 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ASIC1P78348 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ASIC1P78348 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ASIC1P78348 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
ASIC1P78348 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms