Protein–RNA interactions for Protein: P63162

SNRPN, Small nuclear ribonucleoprotein-associated protein N, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPNP63162 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNRPNP63162 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNRPNP63162 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNRPNP63162 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNRPNP63162 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNRPNP63162 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNRPNP63162 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNRPNP63162 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNRPNP63162 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNRPNP63162 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNRPNP63162 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNRPNP63162 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNRPNP63162 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNRPNP63162 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNRPNP63162 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNRPNP63162 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNRPNP63162 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNRPNP63162 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNRPNP63162 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SNRPNP63162 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNRPNP63162 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNRPNP63162 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNRPNP63162 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNRPNP63162 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNRPNP63162 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNRPNP63162 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNRPNP63162 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNRPNP63162 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNRPNP63162 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNRPNP63162 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNRPNP63162 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNRPNP63162 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNRPNP63162 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNRPNP63162 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNRPNP63162 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SNRPNP63162 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNRPNP63162 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SNRPNP63162 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNRPNP63162 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNRPNP63162 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNRPNP63162 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNRPNP63162 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNRPNP63162 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNRPNP63162 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNRPNP63162 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNRPNP63162 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNRPNP63162 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNRPNP63162 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNRPNP63162 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNRPNP63162 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SNRPNP63162 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SNRPNP63162 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SNRPNP63162 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SNRPNP63162 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SNRPNP63162 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SNRPNP63162 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SNRPNP63162 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SNRPNP63162 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SNRPNP63162 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SNRPNP63162 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SNRPNP63162 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SNRPNP63162 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SNRPNP63162 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SNRPNP63162 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SNRPNP63162 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SNRPNP63162 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SNRPNP63162 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SNRPNP63162 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SNRPNP63162 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SNRPNP63162 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SNRPNP63162 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SNRPNP63162 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SNRPNP63162 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SNRPNP63162 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SNRPNP63162 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SNRPNP63162 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SNRPNP63162 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SNRPNP63162 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SNRPNP63162 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SNRPNP63162 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SNRPNP63162 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SNRPNP63162 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SNRPNP63162 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SNRPNP63162 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SNRPNP63162 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SNRPNP63162 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SNRPNP63162 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SNRPNP63162 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SNRPNP63162 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SNRPNP63162 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SNRPNP63162 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SNRPNP63162 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SNRPNP63162 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SNRPNP63162 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SNRPNP63162 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SNRPNP63162 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SNRPNP63162 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SNRPNP63162 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SNRPNP63162 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SNRPNP63162 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms