Protein–RNA interactions for Protein: P63136

ERVK-25, Endogenous retrovirus group K member 25 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 954 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-25P63136 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVK-25P63136 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVK-25P63136 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVK-25P63136 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVK-25P63136 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVK-25P63136 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVK-25P63136 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVK-25P63136 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVK-25P63136 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVK-25P63136 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVK-25P63136 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVK-25P63136 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVK-25P63136 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVK-25P63136 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVK-25P63136 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVK-25P63136 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVK-25P63136 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVK-25P63136 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVK-25P63136 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVK-25P63136 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVK-25P63136 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVK-25P63136 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVK-25P63136 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVK-25P63136 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVK-25P63136 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVK-25P63136 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVK-25P63136 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVK-25P63136 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVK-25P63136 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVK-25P63136 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVK-25P63136 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVK-25P63136 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVK-25P63136 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVK-25P63136 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVK-25P63136 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVK-25P63136 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVK-25P63136 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVK-25P63136 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVK-25P63136 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVK-25P63136 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVK-25P63136 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVK-25P63136 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVK-25P63136 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVK-25P63136 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVK-25P63136 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVK-25P63136 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVK-25P63136 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVK-25P63136 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVK-25P63136 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVK-25P63136 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVK-25P63136 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVK-25P63136 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVK-25P63136 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVK-25P63136 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVK-25P63136 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVK-25P63136 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVK-25P63136 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVK-25P63136 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ERVK-25P63136 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ERVK-25P63136 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ERVK-25P63136 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ERVK-25P63136 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ERVK-25P63136 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ERVK-25P63136 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ERVK-25P63136 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ERVK-25P63136 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ERVK-25P63136 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ERVK-25P63136 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ERVK-25P63136 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ERVK-25P63136 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ERVK-25P63136 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ERVK-25P63136 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ERVK-25P63136 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ERVK-25P63136 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ERVK-25P63136 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ERVK-25P63136 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ERVK-25P63136 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ERVK-25P63136 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ERVK-25P63136 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ERVK-25P63136 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ERVK-25P63136 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ERVK-25P63136 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ERVK-25P63136 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ERVK-25P63136 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
ERVK-25P63136 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ERVK-25P63136 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ERVK-25P63136 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ERVK-25P63136 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ERVK-25P63136 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ERVK-25P63136 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ERVK-25P63136 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ERVK-25P63136 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ERVK-25P63136 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ERVK-25P63136 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ERVK-25P63136 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ERVK-25P63136 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ERVK-25P63136 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ERVK-25P63136 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ERVK-25P63136 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ERVK-25P63136 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms