Protein–RNA interactions for Protein: P62888

RPL30, 60S ribosomal protein L30, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL30P62888 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPL30P62888 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPL30P62888 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPL30P62888 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPL30P62888 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
RPL30P62888 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPL30P62888 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
RPL30P62888 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPL30P62888 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPL30P62888 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPL30P62888 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPL30P62888 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPL30P62888 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPL30P62888 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPL30P62888 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPL30P62888 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPL30P62888 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPL30P62888 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
RPL30P62888 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPL30P62888 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
RPL30P62888 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPL30P62888 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPL30P62888 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPL30P62888 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPL30P62888 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPL30P62888 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPL30P62888 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPL30P62888 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPL30P62888 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPL30P62888 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPL30P62888 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPL30P62888 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPL30P62888 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPL30P62888 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPL30P62888 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPL30P62888 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPL30P62888 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPL30P62888 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPL30P62888 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPL30P62888 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPL30P62888 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPL30P62888 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPL30P62888 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPL30P62888 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPL30P62888 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPL30P62888 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPL30P62888 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPL30P62888 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPL30P62888 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPL30P62888 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPL30P62888 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPL30P62888 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPL30P62888 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPL30P62888 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPL30P62888 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPL30P62888 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPL30P62888 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPL30P62888 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPL30P62888 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPL30P62888 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPL30P62888 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPL30P62888 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPL30P62888 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RPL30P62888 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RPL30P62888 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPL30P62888 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPL30P62888 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPL30P62888 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPL30P62888 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPL30P62888 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPL30P62888 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPL30P62888 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPL30P62888 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPL30P62888 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RPL30P62888 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPL30P62888 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPL30P62888 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPL30P62888 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPL30P62888 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPL30P62888 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPL30P62888 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPL30P62888 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPL30P62888 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPL30P62888 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPL30P62888 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPL30P62888 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPL30P62888 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPL30P62888 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPL30P62888 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPL30P62888 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
RPL30P62888 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPL30P62888 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPL30P62888 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPL30P62888 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPL30P62888 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPL30P62888 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPL30P62888 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPL30P62888 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPL30P62888 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPL30P62888 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms