Protein–RNA interactions for Protein: P62273

RPS29, 40S ribosomal protein S29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P62273 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
RPS29P62273 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC11.23□□□□□ -0.61
RPS29P62273 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
RPS29P62273 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
RPS29P62273 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
RPS29P62273 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
RPS29P62273 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
RPS29P62273 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
RPS29P62273 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
RPS29P62273 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
RPS29P62273 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
RPS29P62273 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
RPS29P62273 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
RPS29P62273 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
RPS29P62273 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
RPS29P62273 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
RPS29P62273 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
RPS29P62273 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
RPS29P62273 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
RPS29P62273 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
RPS29P62273 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
RPS29P62273 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
RPS29P62273 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
RPS29P62273 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
RPS29P62273 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
RPS29P62273 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
RPS29P62273 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
RPS29P62273 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
RPS29P62273 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
RPS29P62273 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
RPS29P62273 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
RPS29P62273 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
RPS29P62273 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
RPS29P62273 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
RPS29P62273 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
RPS29P62273 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
RPS29P62273 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
RPS29P62273 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
RPS29P62273 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
RPS29P62273 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
RPS29P62273 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
RPS29P62273 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
RPS29P62273 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
RPS29P62273 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
RPS29P62273 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
RPS29P62273 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
RPS29P62273 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
RPS29P62273 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
RPS29P62273 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
RPS29P62273 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
RPS29P62273 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
RPS29P62273 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
RPS29P62273 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
RPS29P62273 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
RPS29P62273 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
RPS29P62273 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
RPS29P62273 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
RPS29P62273 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
RPS29P62273 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
RPS29P62273 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
RPS29P62273 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
RPS29P62273 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
RPS29P62273 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
RPS29P62273 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
RPS29P62273 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
RPS29P62273 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
RPS29P62273 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
RPS29P62273 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
RPS29P62273 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
RPS29P62273 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
RPS29P62273 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
RPS29P62273 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
RPS29P62273 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
RPS29P62273 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
RPS29P62273 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
RPS29P62273 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
RPS29P62273 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
RPS29P62273 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
RPS29P62273 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
RPS29P62273 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
RPS29P62273 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
RPS29P62273 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
RPS29P62273 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
RPS29P62273 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
RPS29P62273 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
RPS29P62273 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
RPS29P62273 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
RPS29P62273 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
RPS29P62273 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
RPS29P62273 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
RPS29P62273 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
RPS29P62273 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
RPS29P62273 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
RPS29P62273 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
RPS29P62273 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
RPS29P62273 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
RPS29P62273 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
RPS29P62273 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
RPS29P62273 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
RPS29P62273 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms