Protein–RNA interactions for Protein: P61960

UFM1, Ubiquitin-fold modifier 1, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFM1P61960 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
UFM1P61960 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
UFM1P61960 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
UFM1P61960 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
UFM1P61960 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
UFM1P61960 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
UFM1P61960 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
UFM1P61960 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
UFM1P61960 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
UFM1P61960 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
UFM1P61960 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
UFM1P61960 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
UFM1P61960 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
UFM1P61960 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
UFM1P61960 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
UFM1P61960 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
UFM1P61960 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
UFM1P61960 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
UFM1P61960 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
UFM1P61960 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
UFM1P61960 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
UFM1P61960 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
UFM1P61960 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
UFM1P61960 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
UFM1P61960 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
UFM1P61960 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
UFM1P61960 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
UFM1P61960 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
UFM1P61960 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
UFM1P61960 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
UFM1P61960 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
UFM1P61960 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
UFM1P61960 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
UFM1P61960 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
UFM1P61960 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
UFM1P61960 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
UFM1P61960 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
UFM1P61960 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
UFM1P61960 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
UFM1P61960 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
UFM1P61960 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
UFM1P61960 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
UFM1P61960 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
UFM1P61960 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
UFM1P61960 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
UFM1P61960 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
UFM1P61960 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
UFM1P61960 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
UFM1P61960 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
UFM1P61960 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
UFM1P61960 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
UFM1P61960 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
UFM1P61960 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
UFM1P61960 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
UFM1P61960 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
UFM1P61960 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
UFM1P61960 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
UFM1P61960 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
UFM1P61960 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
UFM1P61960 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
UFM1P61960 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
UFM1P61960 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
UFM1P61960 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
UFM1P61960 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
UFM1P61960 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
UFM1P61960 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
UFM1P61960 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
UFM1P61960 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
UFM1P61960 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
UFM1P61960 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
UFM1P61960 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
UFM1P61960 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
UFM1P61960 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
UFM1P61960 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
UFM1P61960 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
UFM1P61960 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
UFM1P61960 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
UFM1P61960 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
UFM1P61960 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
UFM1P61960 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
UFM1P61960 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.61
UFM1P61960 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
UFM1P61960 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
UFM1P61960 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
UFM1P61960 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.61
UFM1P61960 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
UFM1P61960 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
UFM1P61960 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
UFM1P61960 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC18.83■□□□□ 0.6
UFM1P61960 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
UFM1P61960 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
UFM1P61960 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
UFM1P61960 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
UFM1P61960 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
UFM1P61960 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
UFM1P61960 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
UFM1P61960 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
UFM1P61960 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
UFM1P61960 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
UFM1P61960 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms