Protein–RNA interactions for Protein: P61020

RAB5B, Ras-related protein Rab-5B, humanhuman

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB5BP61020 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB5BP61020 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB5BP61020 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB5BP61020 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB5BP61020 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB5BP61020 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB5BP61020 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB5BP61020 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB5BP61020 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB5BP61020 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB5BP61020 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB5BP61020 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB5BP61020 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB5BP61020 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB5BP61020 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB5BP61020 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB5BP61020 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB5BP61020 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB5BP61020 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB5BP61020 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB5BP61020 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB5BP61020 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB5BP61020 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB5BP61020 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB5BP61020 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB5BP61020 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB5BP61020 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB5BP61020 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB5BP61020 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB5BP61020 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB5BP61020 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB5BP61020 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB5BP61020 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB5BP61020 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB5BP61020 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB5BP61020 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB5BP61020 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB5BP61020 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB5BP61020 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB5BP61020 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB5BP61020 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB5BP61020 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB5BP61020 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB5BP61020 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB5BP61020 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB5BP61020 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB5BP61020 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB5BP61020 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB5BP61020 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB5BP61020 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB5BP61020 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB5BP61020 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB5BP61020 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB5BP61020 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB5BP61020 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB5BP61020 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB5BP61020 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB5BP61020 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB5BP61020 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB5BP61020 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB5BP61020 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB5BP61020 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB5BP61020 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB5BP61020 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB5BP61020 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB5BP61020 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB5BP61020 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB5BP61020 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB5BP61020 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB5BP61020 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB5BP61020 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB5BP61020 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB5BP61020 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB5BP61020 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB5BP61020 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB5BP61020 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB5BP61020 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB5BP61020 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB5BP61020 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB5BP61020 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB5BP61020 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB5BP61020 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB5BP61020 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB5BP61020 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB5BP61020 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB5BP61020 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB5BP61020 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB5BP61020 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RAB5BP61020 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RAB5BP61020 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
RAB5BP61020 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RAB5BP61020 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB5BP61020 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB5BP61020 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB5BP61020 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB5BP61020 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB5BP61020 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB5BP61020 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB5BP61020 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB5BP61020 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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