Protein–RNA interactions for Protein: P60510

PPP4C, Serine/threonine-protein phosphatase 4 catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP4CP60510 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PPP4CP60510 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPP4CP60510 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PPP4CP60510 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPP4CP60510 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPP4CP60510 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPP4CP60510 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPP4CP60510 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPP4CP60510 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPP4CP60510 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PPP4CP60510 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PPP4CP60510 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPP4CP60510 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPP4CP60510 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPP4CP60510 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPP4CP60510 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPP4CP60510 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPP4CP60510 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPP4CP60510 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPP4CP60510 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PPP4CP60510 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPP4CP60510 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPP4CP60510 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPP4CP60510 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPP4CP60510 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PPP4CP60510 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPP4CP60510 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPP4CP60510 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPP4CP60510 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPP4CP60510 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PPP4CP60510 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PPP4CP60510 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPP4CP60510 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPP4CP60510 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPP4CP60510 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPP4CP60510 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPP4CP60510 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPP4CP60510 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPP4CP60510 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPP4CP60510 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPP4CP60510 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPP4CP60510 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPP4CP60510 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPP4CP60510 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPP4CP60510 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPP4CP60510 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPP4CP60510 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPP4CP60510 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPP4CP60510 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPP4CP60510 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPP4CP60510 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPP4CP60510 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PPP4CP60510 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PPP4CP60510 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PPP4CP60510 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PPP4CP60510 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PPP4CP60510 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PPP4CP60510 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PPP4CP60510 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PPP4CP60510 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PPP4CP60510 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PPP4CP60510 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PPP4CP60510 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PPP4CP60510 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PPP4CP60510 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PPP4CP60510 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PPP4CP60510 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PPP4CP60510 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PPP4CP60510 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PPP4CP60510 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PPP4CP60510 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PPP4CP60510 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PPP4CP60510 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PPP4CP60510 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PPP4CP60510 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PPP4CP60510 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PPP4CP60510 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PPP4CP60510 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PPP4CP60510 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PPP4CP60510 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PPP4CP60510 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PPP4CP60510 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PPP4CP60510 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PPP4CP60510 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PPP4CP60510 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PPP4CP60510 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PPP4CP60510 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PPP4CP60510 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PPP4CP60510 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PPP4CP60510 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PPP4CP60510 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PPP4CP60510 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PPP4CP60510 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PPP4CP60510 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PPP4CP60510 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PPP4CP60510 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PPP4CP60510 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PPP4CP60510 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PPP4CP60510 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PPP4CP60510 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms