Protein–RNA interactions for Protein: P59665

DEFA1, Neutrophil defensin 1, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA1P59665 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
DEFA1P59665 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DEFA1P59665 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DEFA1P59665 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DEFA1P59665 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DEFA1P59665 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DEFA1P59665 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DEFA1P59665 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DEFA1P59665 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DEFA1P59665 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DEFA1P59665 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DEFA1P59665 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DEFA1P59665 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DEFA1P59665 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DEFA1P59665 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DEFA1P59665 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DEFA1P59665 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DEFA1P59665 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DEFA1P59665 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DEFA1P59665 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DEFA1P59665 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DEFA1P59665 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DEFA1P59665 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DEFA1P59665 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DEFA1P59665 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DEFA1P59665 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DEFA1P59665 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DEFA1P59665 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
DEFA1P59665 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DEFA1P59665 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DEFA1P59665 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DEFA1P59665 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DEFA1P59665 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DEFA1P59665 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DEFA1P59665 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DEFA1P59665 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DEFA1P59665 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DEFA1P59665 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DEFA1P59665 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DEFA1P59665 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DEFA1P59665 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DEFA1P59665 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DEFA1P59665 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DEFA1P59665 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DEFA1P59665 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DEFA1P59665 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DEFA1P59665 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DEFA1P59665 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DEFA1P59665 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DEFA1P59665 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DEFA1P59665 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DEFA1P59665 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DEFA1P59665 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DEFA1P59665 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DEFA1P59665 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DEFA1P59665 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DEFA1P59665 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DEFA1P59665 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DEFA1P59665 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DEFA1P59665 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DEFA1P59665 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DEFA1P59665 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DEFA1P59665 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DEFA1P59665 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DEFA1P59665 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DEFA1P59665 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DEFA1P59665 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DEFA1P59665 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DEFA1P59665 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DEFA1P59665 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DEFA1P59665 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DEFA1P59665 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DEFA1P59665 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DEFA1P59665 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DEFA1P59665 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DEFA1P59665 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DEFA1P59665 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DEFA1P59665 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DEFA1P59665 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DEFA1P59665 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DEFA1P59665 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DEFA1P59665 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DEFA1P59665 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DEFA1P59665 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DEFA1P59665 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DEFA1P59665 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DEFA1P59665 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DEFA1P59665 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DEFA1P59665 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DEFA1P59665 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DEFA1P59665 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DEFA1P59665 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DEFA1P59665 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DEFA1P59665 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DEFA1P59665 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DEFA1P59665 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DEFA1P59665 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DEFA1P59665 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DEFA1P59665 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DEFA1P59665 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms