Protein–RNA interactions for Protein: P58872

RHBDL3, Rhomboid-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDL3P58872 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RHBDL3P58872 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RHBDL3P58872 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RHBDL3P58872 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RHBDL3P58872 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RHBDL3P58872 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RHBDL3P58872 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RHBDL3P58872 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RHBDL3P58872 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RHBDL3P58872 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RHBDL3P58872 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RHBDL3P58872 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RHBDL3P58872 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RHBDL3P58872 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RHBDL3P58872 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RHBDL3P58872 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RHBDL3P58872 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RHBDL3P58872 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RHBDL3P58872 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RHBDL3P58872 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RHBDL3P58872 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RHBDL3P58872 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RHBDL3P58872 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
RHBDL3P58872 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RHBDL3P58872 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RHBDL3P58872 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RHBDL3P58872 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RHBDL3P58872 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RHBDL3P58872 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RHBDL3P58872 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RHBDL3P58872 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RHBDL3P58872 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RHBDL3P58872 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
RHBDL3P58872 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RHBDL3P58872 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RHBDL3P58872 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RHBDL3P58872 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RHBDL3P58872 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RHBDL3P58872 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RHBDL3P58872 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RHBDL3P58872 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
RHBDL3P58872 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RHBDL3P58872 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RHBDL3P58872 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RHBDL3P58872 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RHBDL3P58872 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
RHBDL3P58872 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RHBDL3P58872 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RHBDL3P58872 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RHBDL3P58872 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RHBDL3P58872 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RHBDL3P58872 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RHBDL3P58872 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RHBDL3P58872 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RHBDL3P58872 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RHBDL3P58872 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RHBDL3P58872 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RHBDL3P58872 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RHBDL3P58872 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RHBDL3P58872 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RHBDL3P58872 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RHBDL3P58872 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RHBDL3P58872 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RHBDL3P58872 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
RHBDL3P58872 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RHBDL3P58872 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RHBDL3P58872 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RHBDL3P58872 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RHBDL3P58872 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
RHBDL3P58872 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
RHBDL3P58872 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RHBDL3P58872 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RHBDL3P58872 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RHBDL3P58872 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RHBDL3P58872 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RHBDL3P58872 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RHBDL3P58872 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RHBDL3P58872 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RHBDL3P58872 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RHBDL3P58872 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RHBDL3P58872 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
RHBDL3P58872 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RHBDL3P58872 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RHBDL3P58872 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RHBDL3P58872 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RHBDL3P58872 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RHBDL3P58872 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RHBDL3P58872 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
RHBDL3P58872 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RHBDL3P58872 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RHBDL3P58872 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RHBDL3P58872 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RHBDL3P58872 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RHBDL3P58872 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
RHBDL3P58872 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
RHBDL3P58872 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RHBDL3P58872 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RHBDL3P58872 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
RHBDL3P58872 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RHBDL3P58872 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms