Protein–RNA interactions for Protein: P58215

LOXL3, Lysyl oxidase homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL3P58215 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LOXL3P58215 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LOXL3P58215 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LOXL3P58215 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LOXL3P58215 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LOXL3P58215 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LOXL3P58215 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LOXL3P58215 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LOXL3P58215 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LOXL3P58215 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LOXL3P58215 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LOXL3P58215 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LOXL3P58215 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LOXL3P58215 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LOXL3P58215 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
LOXL3P58215 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LOXL3P58215 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LOXL3P58215 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LOXL3P58215 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LOXL3P58215 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LOXL3P58215 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LOXL3P58215 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LOXL3P58215 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LOXL3P58215 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LOXL3P58215 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LOXL3P58215 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LOXL3P58215 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LOXL3P58215 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LOXL3P58215 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LOXL3P58215 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LOXL3P58215 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LOXL3P58215 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LOXL3P58215 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LOXL3P58215 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LOXL3P58215 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
LOXL3P58215 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LOXL3P58215 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
LOXL3P58215 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
LOXL3P58215 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
LOXL3P58215 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LOXL3P58215 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
LOXL3P58215 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LOXL3P58215 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LOXL3P58215 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LOXL3P58215 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LOXL3P58215 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LOXL3P58215 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LOXL3P58215 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LOXL3P58215 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LOXL3P58215 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LOXL3P58215 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LOXL3P58215 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LOXL3P58215 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LOXL3P58215 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LOXL3P58215 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LOXL3P58215 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LOXL3P58215 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LOXL3P58215 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LOXL3P58215 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LOXL3P58215 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LOXL3P58215 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LOXL3P58215 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LOXL3P58215 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LOXL3P58215 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LOXL3P58215 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LOXL3P58215 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LOXL3P58215 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LOXL3P58215 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LOXL3P58215 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LOXL3P58215 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LOXL3P58215 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LOXL3P58215 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
LOXL3P58215 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LOXL3P58215 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LOXL3P58215 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LOXL3P58215 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LOXL3P58215 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
LOXL3P58215 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LOXL3P58215 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LOXL3P58215 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LOXL3P58215 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
LOXL3P58215 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LOXL3P58215 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LOXL3P58215 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LOXL3P58215 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LOXL3P58215 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LOXL3P58215 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LOXL3P58215 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LOXL3P58215 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LOXL3P58215 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LOXL3P58215 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LOXL3P58215 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LOXL3P58215 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LOXL3P58215 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LOXL3P58215 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LOXL3P58215 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LOXL3P58215 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LOXL3P58215 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LOXL3P58215 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LOXL3P58215 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms