Protein–RNA interactions for Protein: P57053

H2BFS, Histone H2B type F-S, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2BFSP57053 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
H2BFSP57053 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
H2BFSP57053 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
H2BFSP57053 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
H2BFSP57053 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
H2BFSP57053 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
H2BFSP57053 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
H2BFSP57053 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
H2BFSP57053 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
H2BFSP57053 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
H2BFSP57053 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
H2BFSP57053 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
H2BFSP57053 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
H2BFSP57053 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
H2BFSP57053 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
H2BFSP57053 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
H2BFSP57053 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
H2BFSP57053 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
H2BFSP57053 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
H2BFSP57053 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
H2BFSP57053 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
H2BFSP57053 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
H2BFSP57053 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
H2BFSP57053 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
H2BFSP57053 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
H2BFSP57053 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
H2BFSP57053 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
H2BFSP57053 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
H2BFSP57053 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
H2BFSP57053 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
H2BFSP57053 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
H2BFSP57053 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
H2BFSP57053 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
H2BFSP57053 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
H2BFSP57053 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
H2BFSP57053 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
H2BFSP57053 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
H2BFSP57053 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
H2BFSP57053 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
H2BFSP57053 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
H2BFSP57053 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
H2BFSP57053 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
H2BFSP57053 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
H2BFSP57053 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
H2BFSP57053 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
H2BFSP57053 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
H2BFSP57053 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
H2BFSP57053 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
H2BFSP57053 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
H2BFSP57053 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
H2BFSP57053 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
H2BFSP57053 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
H2BFSP57053 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
H2BFSP57053 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
H2BFSP57053 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
H2BFSP57053 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
H2BFSP57053 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
H2BFSP57053 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
H2BFSP57053 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
H2BFSP57053 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
H2BFSP57053 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
H2BFSP57053 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
H2BFSP57053 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
H2BFSP57053 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
H2BFSP57053 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
H2BFSP57053 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
H2BFSP57053 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
H2BFSP57053 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
H2BFSP57053 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
H2BFSP57053 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
H2BFSP57053 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
H2BFSP57053 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
H2BFSP57053 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
H2BFSP57053 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
H2BFSP57053 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
H2BFSP57053 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
H2BFSP57053 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
H2BFSP57053 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
H2BFSP57053 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
H2BFSP57053 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
H2BFSP57053 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
H2BFSP57053 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
H2BFSP57053 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
H2BFSP57053 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
H2BFSP57053 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
H2BFSP57053 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
H2BFSP57053 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
H2BFSP57053 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
H2BFSP57053 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
H2BFSP57053 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
H2BFSP57053 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
H2BFSP57053 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
H2BFSP57053 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
H2BFSP57053 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
H2BFSP57053 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
H2BFSP57053 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
H2BFSP57053 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
H2BFSP57053 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
H2BFSP57053 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
H2BFSP57053 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms