Protein–RNA interactions for Protein: P56282

POLE2, DNA polymerase epsilon subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLE2P56282 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
POLE2P56282 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
POLE2P56282 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
POLE2P56282 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
POLE2P56282 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
POLE2P56282 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
POLE2P56282 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
POLE2P56282 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
POLE2P56282 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
POLE2P56282 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
POLE2P56282 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
POLE2P56282 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
POLE2P56282 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
POLE2P56282 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
POLE2P56282 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
POLE2P56282 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
POLE2P56282 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
POLE2P56282 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
POLE2P56282 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
POLE2P56282 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
POLE2P56282 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
POLE2P56282 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
POLE2P56282 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
POLE2P56282 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
POLE2P56282 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
POLE2P56282 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
POLE2P56282 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
POLE2P56282 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
POLE2P56282 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
POLE2P56282 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
POLE2P56282 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
POLE2P56282 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
POLE2P56282 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
POLE2P56282 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
POLE2P56282 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
POLE2P56282 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
POLE2P56282 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
POLE2P56282 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
POLE2P56282 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
POLE2P56282 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
POLE2P56282 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
POLE2P56282 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
POLE2P56282 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
POLE2P56282 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
POLE2P56282 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
POLE2P56282 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
POLE2P56282 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
POLE2P56282 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
POLE2P56282 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
POLE2P56282 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
POLE2P56282 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
POLE2P56282 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
POLE2P56282 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
POLE2P56282 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
POLE2P56282 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
POLE2P56282 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
POLE2P56282 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
POLE2P56282 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
POLE2P56282 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
POLE2P56282 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
POLE2P56282 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
POLE2P56282 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
POLE2P56282 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
POLE2P56282 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
POLE2P56282 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
POLE2P56282 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
POLE2P56282 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
POLE2P56282 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
POLE2P56282 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
POLE2P56282 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
POLE2P56282 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
POLE2P56282 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
POLE2P56282 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
POLE2P56282 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
POLE2P56282 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
POLE2P56282 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
POLE2P56282 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
POLE2P56282 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
POLE2P56282 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
POLE2P56282 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
POLE2P56282 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
POLE2P56282 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
POLE2P56282 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
POLE2P56282 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
POLE2P56282 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
POLE2P56282 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
POLE2P56282 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
POLE2P56282 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
POLE2P56282 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
POLE2P56282 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
POLE2P56282 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
POLE2P56282 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
POLE2P56282 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
POLE2P56282 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
POLE2P56282 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
POLE2P56282 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
POLE2P56282 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
POLE2P56282 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
POLE2P56282 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
POLE2P56282 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.2 ms