Protein–RNA interactions for Protein: P55327

TPD52, Tumor protein D52, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPD52P55327 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TPD52P55327 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TPD52P55327 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TPD52P55327 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
TPD52P55327 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TPD52P55327 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TPD52P55327 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TPD52P55327 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TPD52P55327 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TPD52P55327 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TPD52P55327 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TPD52P55327 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TPD52P55327 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TPD52P55327 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TPD52P55327 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TPD52P55327 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TPD52P55327 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TPD52P55327 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TPD52P55327 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TPD52P55327 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TPD52P55327 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TPD52P55327 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TPD52P55327 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TPD52P55327 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
TPD52P55327 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TPD52P55327 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TPD52P55327 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
TPD52P55327 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TPD52P55327 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TPD52P55327 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TPD52P55327 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TPD52P55327 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TPD52P55327 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TPD52P55327 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TPD52P55327 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TPD52P55327 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TPD52P55327 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TPD52P55327 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TPD52P55327 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TPD52P55327 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TPD52P55327 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TPD52P55327 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TPD52P55327 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TPD52P55327 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TPD52P55327 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TPD52P55327 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TPD52P55327 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TPD52P55327 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TPD52P55327 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
TPD52P55327 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TPD52P55327 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TPD52P55327 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
TPD52P55327 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TPD52P55327 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TPD52P55327 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TPD52P55327 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TPD52P55327 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TPD52P55327 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TPD52P55327 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TPD52P55327 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
TPD52P55327 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TPD52P55327 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TPD52P55327 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TPD52P55327 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TPD52P55327 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TPD52P55327 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TPD52P55327 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TPD52P55327 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TPD52P55327 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TPD52P55327 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TPD52P55327 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TPD52P55327 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TPD52P55327 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TPD52P55327 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TPD52P55327 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TPD52P55327 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TPD52P55327 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TPD52P55327 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TPD52P55327 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TPD52P55327 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TPD52P55327 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TPD52P55327 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
TPD52P55327 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TPD52P55327 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TPD52P55327 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TPD52P55327 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TPD52P55327 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TPD52P55327 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TPD52P55327 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TPD52P55327 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TPD52P55327 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TPD52P55327 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TPD52P55327 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TPD52P55327 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TPD52P55327 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TPD52P55327 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TPD52P55327 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TPD52P55327 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TPD52P55327 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TPD52P55327 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms