Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PGGT1BP53609 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PGGT1BP53609 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PGGT1BP53609 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PGGT1BP53609 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PGGT1BP53609 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PGGT1BP53609 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PGGT1BP53609 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PGGT1BP53609 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PGGT1BP53609 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PGGT1BP53609 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PGGT1BP53609 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PGGT1BP53609 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PGGT1BP53609 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
PGGT1BP53609 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PGGT1BP53609 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PGGT1BP53609 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PGGT1BP53609 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PGGT1BP53609 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
PGGT1BP53609 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
PGGT1BP53609 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PGGT1BP53609 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PGGT1BP53609 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PGGT1BP53609 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PGGT1BP53609 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PGGT1BP53609 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PGGT1BP53609 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PGGT1BP53609 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PGGT1BP53609 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PGGT1BP53609 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PGGT1BP53609 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PGGT1BP53609 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PGGT1BP53609 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PGGT1BP53609 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PGGT1BP53609 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PGGT1BP53609 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PGGT1BP53609 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PGGT1BP53609 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PGGT1BP53609 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PGGT1BP53609 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PGGT1BP53609 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
PGGT1BP53609 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PGGT1BP53609 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PGGT1BP53609 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PGGT1BP53609 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PGGT1BP53609 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PGGT1BP53609 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PGGT1BP53609 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PGGT1BP53609 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PGGT1BP53609 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PGGT1BP53609 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PGGT1BP53609 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PGGT1BP53609 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PGGT1BP53609 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PGGT1BP53609 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
PGGT1BP53609 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PGGT1BP53609 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PGGT1BP53609 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PGGT1BP53609 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PGGT1BP53609 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PGGT1BP53609 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PGGT1BP53609 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PGGT1BP53609 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PGGT1BP53609 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PGGT1BP53609 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PGGT1BP53609 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PGGT1BP53609 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PGGT1BP53609 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PGGT1BP53609 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PGGT1BP53609 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PGGT1BP53609 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PGGT1BP53609 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PGGT1BP53609 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PGGT1BP53609 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PGGT1BP53609 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
PGGT1BP53609 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PGGT1BP53609 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
PGGT1BP53609 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
PGGT1BP53609 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PGGT1BP53609 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PGGT1BP53609 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PGGT1BP53609 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PGGT1BP53609 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PGGT1BP53609 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PGGT1BP53609 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PGGT1BP53609 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PGGT1BP53609 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PGGT1BP53609 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
PGGT1BP53609 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PGGT1BP53609 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
PGGT1BP53609 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PGGT1BP53609 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PGGT1BP53609 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PGGT1BP53609 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PGGT1BP53609 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PGGT1BP53609 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PGGT1BP53609 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PGGT1BP53609 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PGGT1BP53609 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PGGT1BP53609 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
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