Protein–RNA interactions for Protein: P52797

EFNA3, Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA3P52797 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
EFNA3P52797 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
EFNA3P52797 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
EFNA3P52797 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
EFNA3P52797 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
EFNA3P52797 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
EFNA3P52797 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
EFNA3P52797 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
EFNA3P52797 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
EFNA3P52797 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
EFNA3P52797 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
EFNA3P52797 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
EFNA3P52797 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
EFNA3P52797 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
EFNA3P52797 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
EFNA3P52797 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
EFNA3P52797 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EFNA3P52797 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EFNA3P52797 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EFNA3P52797 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EFNA3P52797 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EFNA3P52797 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EFNA3P52797 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EFNA3P52797 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EFNA3P52797 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EFNA3P52797 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EFNA3P52797 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EFNA3P52797 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EFNA3P52797 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
EFNA3P52797 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EFNA3P52797 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
EFNA3P52797 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EFNA3P52797 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EFNA3P52797 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EFNA3P52797 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EFNA3P52797 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EFNA3P52797 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EFNA3P52797 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EFNA3P52797 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EFNA3P52797 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EFNA3P52797 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EFNA3P52797 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EFNA3P52797 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EFNA3P52797 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
EFNA3P52797 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EFNA3P52797 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EFNA3P52797 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
EFNA3P52797 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
EFNA3P52797 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EFNA3P52797 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EFNA3P52797 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
EFNA3P52797 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EFNA3P52797 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
EFNA3P52797 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
EFNA3P52797 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
EFNA3P52797 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EFNA3P52797 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EFNA3P52797 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
EFNA3P52797 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EFNA3P52797 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EFNA3P52797 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
EFNA3P52797 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EFNA3P52797 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EFNA3P52797 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EFNA3P52797 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EFNA3P52797 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
EFNA3P52797 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
EFNA3P52797 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
EFNA3P52797 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EFNA3P52797 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EFNA3P52797 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EFNA3P52797 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
EFNA3P52797 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EFNA3P52797 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EFNA3P52797 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EFNA3P52797 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EFNA3P52797 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EFNA3P52797 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EFNA3P52797 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EFNA3P52797 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EFNA3P52797 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EFNA3P52797 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EFNA3P52797 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EFNA3P52797 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EFNA3P52797 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EFNA3P52797 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EFNA3P52797 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EFNA3P52797 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EFNA3P52797 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EFNA3P52797 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EFNA3P52797 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EFNA3P52797 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EFNA3P52797 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
EFNA3P52797 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EFNA3P52797 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EFNA3P52797 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EFNA3P52797 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EFNA3P52797 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EFNA3P52797 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EFNA3P52797 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms