Protein–RNA interactions for Protein: P52294

KPNA1, Importin subunit alpha-5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 538 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KPNA1P52294 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
KPNA1P52294 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
KPNA1P52294 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
KPNA1P52294 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
KPNA1P52294 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
KPNA1P52294 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
KPNA1P52294 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
KPNA1P52294 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
KPNA1P52294 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
KPNA1P52294 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
KPNA1P52294 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
KPNA1P52294 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
KPNA1P52294 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
KPNA1P52294 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
KPNA1P52294 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
KPNA1P52294 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
KPNA1P52294 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
KPNA1P52294 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
KPNA1P52294 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
KPNA1P52294 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
KPNA1P52294 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
KPNA1P52294 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
KPNA1P52294 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
KPNA1P52294 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
KPNA1P52294 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
KPNA1P52294 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
KPNA1P52294 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
KPNA1P52294 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
KPNA1P52294 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
KPNA1P52294 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
KPNA1P52294 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
KPNA1P52294 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
KPNA1P52294 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
KPNA1P52294 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
KPNA1P52294 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
KPNA1P52294 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
KPNA1P52294 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
KPNA1P52294 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
KPNA1P52294 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
KPNA1P52294 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
KPNA1P52294 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
KPNA1P52294 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
KPNA1P52294 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
KPNA1P52294 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
KPNA1P52294 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
KPNA1P52294 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
KPNA1P52294 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
KPNA1P52294 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
KPNA1P52294 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KPNA1P52294 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KPNA1P52294 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
KPNA1P52294 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KPNA1P52294 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
KPNA1P52294 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KPNA1P52294 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
KPNA1P52294 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
KPNA1P52294 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
KPNA1P52294 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
KPNA1P52294 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
KPNA1P52294 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
KPNA1P52294 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KPNA1P52294 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KPNA1P52294 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
KPNA1P52294 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
KPNA1P52294 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
KPNA1P52294 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KPNA1P52294 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
KPNA1P52294 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
KPNA1P52294 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
KPNA1P52294 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KPNA1P52294 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
KPNA1P52294 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KPNA1P52294 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
KPNA1P52294 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KPNA1P52294 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KPNA1P52294 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KPNA1P52294 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KPNA1P52294 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KPNA1P52294 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
KPNA1P52294 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
KPNA1P52294 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
KPNA1P52294 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
KPNA1P52294 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
KPNA1P52294 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
KPNA1P52294 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
KPNA1P52294 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KPNA1P52294 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KPNA1P52294 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
KPNA1P52294 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KPNA1P52294 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KPNA1P52294 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KPNA1P52294 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
KPNA1P52294 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
KPNA1P52294 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
KPNA1P52294 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
KPNA1P52294 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
KPNA1P52294 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
KPNA1P52294 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
KPNA1P52294 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
KPNA1P52294 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms